L'histoire de Schierstein remonte loin dans le temps, comme en témoignent les découvertes néolithiques, romaines et franques. Le témoignage archéologique le plus spectaculaire est la colonne des géants de Jupiter datant de 221 après J.-C. Vers 973, le lieu est mentionné pour la première fois sous le nom de Skerdesstein. Le nom est interprété comme "pierre de Sherto", "pierre" étant à interpréter dans le sens de construction fortifiée.

Il est probable qu'une église paroissiale ait existé à Schierstein au plus tard au 9ème siècle. La ferme de la dîme et l'église royale sont des reliques de propriétés qui faisaient autrefois partie du domaine impérial. Plus tard, les monastères et couvents de Mayence ainsi que les monastères de Tiefenthal et d'Eberbach du Rheingau ont pris pied ici. La noblesse locale a fondé plusieurs résidences de chevaliers à Schierstein ; les comtes de Nassau, qui ont intégré Schierstein dans leur seigneurie de Wiesbaden à partir du 12ème siècle, étaient les seuls à détenir la souveraineté sur la localité. Vers 1200, le bailliage et la juridiction de Schierstein étaient détenus par les seigneurs d'Eppstein, qui y possédaient encore des biens au 15ème siècle. En 1275, il existait à Schierstein un tribunal de centaine composé du maire et de sept échevins. En 1547, Schierstein passa à la Réforme. C'est de cette époque que datent les plus anciennes informations sur une école située en face du presbytère. En raison de sa situation géographique favorable, la localité était régulièrement visitée par des troupes de passage, ce qui entraînait par moments un recul flagrant de la population. Ainsi, en 1654, la commune ne comptait plus qu'une cinquantaine d'habitants. Cent ans plus tard, plus de 600 personnes habitaient à nouveau 99 maisons, et en 1880, on comptait 268 maisons et 2.132 personnes. Après un effondrement partiel en 1732, l'ancien bâtiment de l'église au Zehntenhof a été démoli au milieu du 18e siècle et remplacé en 1754 par l'église Christophorus à un autre endroit. L'église catholique St. Peter und Paul, l'église protestante Auferstehungsgemeinde ainsi que la communauté apostolique de Wiesbaden ont été construites plus récemment.

La construction du port de Schierstein au milieu du 19e siècle a été un investissement important pour l'avenir de l'économie locale. Le 11.08.1856, le raccordement à la ligne de chemin de fer Wiesbaden-Oberlahnstein a eu lieu. En 1926, Schierstein a été rattaché à la commune. Dans cette commune aux sols fertiles, la viticulture et l'agriculture ont toujours été les formes d'économie les plus importantes. La viticulture est attestée à Schierstein depuis 973 jusqu'à aujourd'hui. Au 19e siècle, des entreprises industrielles s'y sont installées, notamment la cave de champagne Söhnlein (Rheingold) et les usines métallurgiques Glyco Daalen & Loos.

Avec une population essentiellement ouvrière, la commune penchait vers les partis de gauche à l'époque de Weimar. Mais à partir de 1928, le NSDAP atteint peu à peu la majorité à Schierstein également. Pendant la Nuit de Cristal de novembre 1938, la synagogue de Schierstein, inaugurée en 1890, a été détruite, les appartements et les magasins des habitants juifs ont été profanés, dont les huit derniers ont été déportés vers les camps d'extermination en 1942.

Aujourd'hui (au 01.01.2015), sur 10.203 habitants répartis dans 5.173 ménages, 30,7 % sont issus de l'immigration ; 22 % d'entre eux sont originaires de Turquie et 16,6 % de Grèce. La vie associative est très active à Schierstein. Outre la Turngemeinde Schierstein 1848, elle abrite plusieurs clubs de football, la Freie Turnerschaft Schierstein 1913 et le Wassersportverein Schierstein 1921. En outre, le port de Schierstein est devenu ces dernières années l'un des centres allemands du sport du bateau-dragon. Avec sa plage de plus de 2 ha située à la pointe ouest de la Rettbergsaue, Schierstein dispose depuis 1914 déjà d'une importante installation de loisirs.