La storia di Schierstein affonda le sue radici nel passato, come testimoniano i reperti neolitici, romani e franchi. La testimonianza archeologica più spettacolare è la Colonna Gigante di Giove del 221 d.C. La città fu menzionata per la prima volta con il nome di Skerdesstein intorno al 973. Il nome viene interpretato come "Pietra di Sherto", dove "pietra" va interpretato nel senso di edificio fortificato.

Al più tardi nel IX secolo doveva esistere una chiesa parrocchiale a Schierstein. La fattoria della decima e la chiesa reale sono reliquie di proprietà che appartenevano al feudo imperiale. In seguito, i monasteri e i conventi di Magonza e i monasteri di Tiefenthal ed Eberbach del Rheingau si stabilirono qui. La nobiltà locale fondò diverse sedi cavalleresche a Schierstein; i conti di Nassau avevano la sovranità esclusiva sulla città e incorporarono Schierstein nel loro dominio di Wiesbaden a partire dal XII secolo. Intorno al 1200 i signori di Eppstein detenevano il baliato e la giurisdizione su Schierstein, che ancora nel XV secolo possedevano la città. Nel 1275, Schierstein aveva una corte centrale composta dal sindaco e da sette assessori. Schierstein si convertì alla Riforma nel 1547. Le più antiche testimonianze di una scuola di fronte alla canonica risalgono a quest'epoca. A causa della sua posizione favorevole, il villaggio fu ripetutamente devastato dalle truppe di passaggio, che a volte portarono a un evidente calo della popolazione. Nel 1654, la comunità contava solo circa 50 abitanti. 100 anni dopo, oltre 600 persone vivevano nuovamente in 99 case e nel 1880 si contavano 268 case e 2.132 persone. L'antico edificio della chiesa di Zehntenhof fu demolito a metà del XVIII secolo dopo un parziale crollo nel 1732 e sostituito dalla chiesa di San Cristoforo nel 1754. La chiesa cattolica di San Pietro e Paolo, la parrocchia evangelica della Resurrezione e la parrocchia apostolica di Wiesbaden sono state costruite più recentemente.

La costruzione del porto di Schierstein a metà del XIX secolo fu un importante investimento per il futuro dell'economia locale. L'11 agosto 1856 la città fu collegata alla linea ferroviaria Wiesbaden-Oberlahnstein. Schierstein fu incorporata nel 1926. La viticoltura e l'agricoltura sono sempre state le principali attività economiche del distretto, caratterizzato da un terreno fertile. La viticoltura a Schierstein è attestata dal 973 a oggi. Nel XIX secolo sono sorte imprese industriali, tra cui le cantine di spumanti Söhnlein (Rheingold) e la fabbrica di glicometalli Daalen & Loos.

Con una popolazione prevalentemente operaia, il comune tendeva verso i partiti di sinistra durante il periodo di Weimar. Tuttavia, a partire dal 1928, anche il NSDAP ottenne gradualmente la maggioranza a Schierstein. Durante la Notte del Pogrom del Reich del novembre 1938, la sinagoga di Schierstein, che era stata consacrata nel 1890, fu distrutta e le case e i negozi dei residenti ebrei furono profanati; gli ultimi otto furono deportati nei campi di sterminio nel 1942.

Oggi (al 1° gennaio 2015), il 30,7% dei 10.203 abitanti in 5.173 famiglie ha un background migratorio; il 22% proviene dalla Turchia e il 16,6% dalla Grecia. A Schierstein c'è una vivace scena di club. Oltre alla Turngemeinde Schierstein 1848, ci sono diverse squadre di calcio, la Freie Turnerschaft Schierstein 1913 e il Wassersportverein Schierstein 1921. Negli ultimi anni, il porto di Schierstein si è sviluppato anche come uno dei centri tedeschi dello sport del dragon boat. Dal 1914 Schierstein ospita un'importante struttura per il tempo libero, con un lido di oltre 2 ettari sulla punta occidentale della Rettbergsaue.