Podstawę Muzeum w Wiesbaden stanowiły zbiory Johanna Isaaka Freiherra von Gerninga, które zgodnie z sugestią Johanna Wolfganga von Goethego zostały nabyte przez Księstwo Nassau i początkowo udostępnione publiczności w Erbprinzenpalais. Utworzono trzy muzea, których sponsorami były Stowarzyszenie na rzecz Starożytności i Badań Historycznych Nassau, Stowarzyszenie Historii Naturalnej Nassau i Stowarzyszenie Sztuki Nassau. Stały się one własnością miasta w 1900 roku i były prezentowane w nowym budynku muzealnym zaprojektowanym przez architekta Theodora Fischera od 1920 roku.

W projekcie budynku Fischera połowa galerii obrazów była przeznaczona na wystawy czasowe. W latach dwudziestych i na początku lat trzydziestych XX wieku Nassauischer Kunstverein opracowało tam żywy program wystawienniczy. Ważne uzupełnienia kolekcji w dziedzinie klasycznego modernizmu zostały również dokonane z pomocą mieszkańców Wiesbaden. Obejmowały one liczne obrazy wypożyczone na stałe od kolekcjonera Heinricha Kirchhoffa z Wiesbaden.

Po przejęciu władzy przez nazistów w 1933 roku, wszystkie obrazy z nurtu ekspresjonistycznego i konstruktywistycznego zostały początkowo zmagazynowane, a następnie przeniesione do centralnego centrum przechowywania kolekcji w Poczdamie w 1937 roku. Kirchhoff musiał zwrócić swoje stałe pożyczki. Hermann Voss był dyrektorem muzeum w latach 1935-45. Pod jego kierownictwem nabyto ponad 200 dzieł, w tym wysokiej klasy obrazy barokowe. Od 1943 r. Voss był również specjalnym przedstawicielem Muzeum Führera w Linzu. Prawne pochodzenie jego nabytków jest obecnie badane.

Po zakończeniu wojny muzeum stało się Centralnym Punktem Kolekcjonerskim Amerykanów w Wiesbaden. Po tym, jak tymczasowo przechowywane tu skarby sztuki, w tym Nefertiti, zostały zwrócone właścicielom, w latach 50. i 60. rozpoczęła się faza reorganizacji Muzeum Wiesbaden przy użyciu najbardziej ekonomicznych środków. To właśnie w tym okresie ówczesny dyrektor muzeum Clemens Weiler zaczął budować najważniejszą obecnie kolekcję muzeum - dzieła Alexeja von Jawlensky' ego. W ciągu ostatnich 25 lat została ona rozbudowana pod względem jakości i doboru dzieł, stając się najważniejszą na świecie kolekcją tego artysty. Dział klasycznego modernizmu zyskał dodatkowe znaczenie dzięki 30 obrazom i rysunkom najwyższej klasy z posiadłości Hanny Bekkers vom Rath, które Verein zur Förderung der Bildenden Kunst w Wiesbaden nabył w 1987 roku i udostępnił Muzeum Wiesbaden na zasadzie stałego wypożyczenia. Muzeum specjalizuje się również w sztuce konstruktywnej. Na szczególną uwagę zasługuje tutaj majątek artysty Friedricha Vordemberge-Gildewarta (1899-1962), który został przekazany w 1997 roku, oraz kolekcja dzieł Rosjanina Eduarda Steinberga, która znajduje się w Muzeum Wiesbaden od 2013 roku. W 1962 roku Muzeum Wiesbaden stało się punktem wyjścia dla ruchu Fluxus.

Po przeniesieniu własności Muzeum Wiesbaden na kraj związkowy Hesja w 1973 roku, pierwotnie niezależne trzy muzea stały się trzema oddziałami muzealnymi pod względem organizacyjnym. W związku z planami utworzenia muzeum miejskiego, kolekcja antyków Nassau została zwrócona miastu wiosną 2010 roku. Dzisiejsze dwa działy muzealne, Kolekcje Sztuki i Historii Naturalnej, mają do dyspozycji ponad 7 000^{metrów kwadratowych} powierzchni wystawienniczej.

W 2007 roku Muzeum Wiesbaden zostało uhonorowane przez niemiecką sekcję Międzynarodowego Stowarzyszenia Krytyków Sztuki (AICA) tytułem "Muzeum Roku" za swoją działalność wystawienniczą i pracę w dziedzinie sztuki współczesnej. Muzeum zawdzięcza ten zaszczyt zaostrzeniu profilu swojej kolekcji, koncentrując się na Jawlensky'm i jego otoczeniu, konstruktywizmie w kontekście Friedricha Vordemberge-Gildewarta i tak zwanej cichej awangardzie od lat 60. XX wieku.

Po zakończeniu kompleksowego remontu dwóch skrzydeł budynku, w maju 2013 roku ponownie otwarto wystawę Starych Mistrzów w skrzydle południowym oraz stałą wystawę Zbiorów Historii NaturalWiesbaden. Po tym, jak tymczasowo przechowywane tu skarby sztuki, w tym Nefertiti, zostały zwrócone właścicielom, w latach 50. i 60. rozpoczęła się faza reorganizacji Muzeum Wiesbaden przy użyciu najbardziej ekonomicznych środków. To właśnie w tym okresie ówczesny dyrektor muzeum Clemens Weiler zaczął budować najważniejszą obecnie kolekcję muzeum - dzieła Alexeja von Jawlensky' ego. W ciągu ostatnich 25 lat została ona rozbudowana pod względem jakości i doboru dzieł, stając się najważniejszą na świecie kolekcją tego artysty. Dział klasycznego modernizmu zyskał dodatkowe znaczenie dzięki 30 obrazom i rysunkom najwyższej klasy z posiadłości Hanny Bekkers vom Rath, które Verein zur Förderung der Bildenden Kunst w Wiesbaden nabył w 1987 roku i udostępnił Muzeum Wiesbaden na zasadzie stałego wypożyczenia. Muzeum specjalizuje się również w sztuce konstruktywnej. Na szczególną uwagę zasługuje tutaj majątek artysty Friedricha Vordemberge-Gildewarta (1899-1962), który został przekazany w 1997 roku, oraz kolekcja dzieł Rosjanina Eduarda Steinberga, która znajduje się w Muzeum Wiesbaden od 2013 roku. W 1962 roku Muzeum Wiesbaden stało się punktem wyjścia dla ruchu Fluxus.

Po przeniesieniu własności Muzeum Wiesbaden na kraj związkowy Hesja w 1973 roku, pierwotnie niezależne trzy muzea stały się trzema oddziałami muzealnymi pod względem organizacyjnym. W związku z planami utworzenia muzeum miejskiego, kolekcja antyków Nassau została zwrócona miastu wiosną 2010 roku. Dzisiejsze dwa działy muzealne, Kolekcje Sztuki i Historii Naturalnej, mają do dyspozycji ponad 7 000^{metrów kwadratowych} powierzchni wystawienniczej.

W 2007 roku Muzeum Wiesbaden zostało uhonorowane przez niemiecką sekcję Międzynarodowego Stowarzyszenia Krytyków Sztuki (AICA) tytułem "Muzeum Roku" za swoją działalność wystawienniczą i pracę w dziedzinie sztuki współczesnej. Muzeum zawdzięcza ten zaszczyt zaostrzeniu profilu swojej kolekcji, koncentrując się na Jawlensky'm i jego otoczeniu, konstruktywizmie w kontekście Friedricha Vordemberge-Gildewarta i tak zwanej cichej awangardzie od lat 60. XX wieku.

Po zakończeniu kompleksowego remontu dwóch skrzydeł budynku, w maju 2013 roku ponownie Historii Naturalnej, mają do dyspozycji ponad 7 000^{metrów kwadratowych} powierzchni wystawienniczej.

W 2007 roku Muzeum Wiesbaden zostało uhonorowane przez niemiecką sekcję Międzynarodowego Stowarzyszenia Krytyków Sztuki (AICA) tytułem "Muzeum Roku" za swoją działalność wystawienniczą i pracę w dziedzinie sztuki współczesnej. Muzeum zawdzięcza ten zaszczyt zaostrzeniu profilu swojej kolekcji, koncentrując się na Jawlensky'm i jego otoczeniu, konstruktywizmie w kontekście Friedricha Vordemberge-Gildewarta i tak zwanej cichej awangardzie od lat 60. XX wieku.

Po zakończeniu kompleksowego remontu dwóch skrzydeł budynku, w maju 2013 roku ponownie otwarto wystawę Starych Mistrzów w skrzydle południowym oraz stałą wystawę Zbiorów Historii Naturalnej zatytułowaną "Estetyka natury" w skrzydle północnym muzeum.