Наприкінці існування Веймарської республіки у Вісбадені проживало понад 3 000 євреїв. У 1933 році НСДАП спочатку взялася за відокремлення євреїв від решти населення та їхню соціальну ізоляцію. Перша масштабна антиєврейська кампанія розпочалася 1 квітня 1933 року з бойкоту єврейських магазинів, лікарів та адвокатів, організованого НСДАП. Перед численними магазинами у Вісбадені були вивішені вивіски з написом "Не купуй у євреїв".

Ненависть до євреїв, яку дедалі більше розпалювала партійна пропаганда, а у Вісбадені ще до 1933 року "Нассауер Беобахтер" (пізніше "Нассауер Фольксблат"), газета в стилі "Штюрмер", призвела до знущань і вбивств на ранньому етапі: 27 березня 1933 року власник "1-ї шовкової крамниці у Вісбадені, Вільгельмштрассе, 20" Саломон Розенштраух зазнав нападу та знущань з боку СА. Під час другого нападу на його крамницю 22 квітня 1933 року він зазнав смертельного серцевого нападу. Того ж дня торговець молоком Макс Кассель був застрелений у спину у своїй квартирі на Веберґассе, 13. Жорстокі вбивства, про які в 1933 році все ще повідомляли щоденні газети Вісбадена, хоча і в завуальованій формі, перейшли в більш спокійну фазу звільнення євреїв (і політичних опонентів) з державної служби на підставі "Закону про відновлення професійної державної служби" від 7 квітня 1933 року.

Антисемітизм також мав вплив на школи. Альфред Мільманн, який відвідував середню школу на Рідерберзі, повідомляв, що єврейські учні вже в 1934 році були відокремлені від інших учнів. До своєї еміграції з батьками Альфред Мільманн відвідував єврейську початкову школу у Вісбадені, яка була відкрита в казармах на Майнцерштрассе в 1936 році. Єврейська молодь вже була поступово маргіналізована через виключення з "німецьких" клубів (Gleichschaltung) та заборону несіоністських молодіжних груп і єврейських спортивних клубів. Сіоністським організаціям, однак, які були орієнтовані на еміграцію до Палестини і мали зростаючу кількість членів, було дозволено продовжувати свою діяльність у непублічній сфері. Лише молодіжна секція Рейхскомісаріату єврейських фронтовиків отримала спеціальний дозвіл на спортивну діяльність.

Нюрнберзькі закони 1935 року скасували громадянські права всіх євреїв і заборонили шлюби між євреями і так званими арійцями. Навіть наймання "арійської" домашньої прислуги могло призвести до ув'язнення в концтаборі для обох сторін. Нюрнберзький "Закон про громадянство та захист крові", співавтором якого був доктор Вільгельм Штукарт з Вісбадена, забезпечив "правову" основу для процесу виключення та переслідування. На примусовій праці та аріанізації заробляли не лише великі компанії, такі як IG Farben чи Dresdner Bank, але й малі вісбаденські підприємства та міська адміністрація, які наймали євреїв на дорожні роботи. Найбільша частка арійських активів була конфіскована податковою службою, але значна частина дісталася пересічним громадянам Райху, часто через нацистські благодійні організації.

У 1937 році примусова араїнізація стала основним напрямком антиєврейських заходів - передусім для того, щоб змусити євреїв емігрувати. У 1938 році постійно приймалися нові закони та постанови, які знищували будь-яку економічну діяльність євреїв. Вісбаденська компанія Steinberger & Vorsanger спочатку зазнала великих збитків внаслідок заходів бойкоту. Компанія була арійована 7 березня 1938 року. Наслідком експропріацій стало швидке зубожіння єврейського населення. У той же час, Вісбаденська СА продовжувала свої насильницькі дії. Зростаючі злидні робили еміграцію дедалі складнішою для більшості єврейських родин, а все менше країн приймали євреїв і закривали свої кордони.

Вісбаденська синагога на Міхельсберзі була повністю спалена під час так званої "кришталевої ночі", а інтер'єр Староізраїльської синагоги на Фрідріхштрассе був сплюндрований. Єврейські підприємства також зазнали вандалізму. Майже всі єврейські чоловіки були заарештовані в ніч погрому, включно з відставним вісбаденським рабином д-ром Паулем Лазарусом, і, як і "юридичний радник" д-р Гутманн, призначений представляти євреїв, зазвичай були інтерновані в концтабір Бухенвальд на кілька місяців. У передмістях Бібріха та Ширштайна після руйнування синагог відбувалися жорстокі напади на приватні будинки. Експропріації відзначалися як "де-євреїзація економіки" і були в основному завершені, коли в 1941 році почалася остання фаза переслідувань.

Фаза винищення почалася з перших великих депортацій. Більшість німецького населення було значною мірою поглинуте війною; раптове зникнення цілих родин по сусідству, які спочатку перебували в так званих єврейських будинках, було сприйнято без протесту. З 1 вересня 1941 року всі євреї повинні були носити жовту зірку на одязі. Кожен, хто не носив її відкрито, приховував своє примусове ім'я Сара чи Ізраїль або порушував один з багатьох єврейських приписів, таких як заборона на відвідування курортних садів чи утримання домашніх тварин, і на кого доносили, погрожував бути відправленим до концтабору.

У січні 1942 року у Вісбадені все ще проживало близько 1 000 єврейських чоловіків і жінок. Приблизно стільки ж емігрувало, а деяким вдалося нелегально втекти через кордон. Майже всіх, хто залишився, забрали з естакади скотобійні на головному залізничному вокзалі до таборів знищення під час трьох великих депортацій у березні, червні та вересні 1942 року. Зокрема, 10 червня 1942 року сім'ї з Вісбадена були депортовані до Собібора або Майданека. "Евакуйований на Схід" було написано на картотеках гестапо, за допомогою яких вони прискіпливо намагалися зареєструвати кожного єврея в місті. Ця депортація вразила єврейську громаду до глибини душі; цілі сім'ї навмисно вносили до депортаційних списків. Залишилися переважно люди похилого віку та євреї, які перебували у так званому змішаному шлюбі, або фронтовики, які воювали за Німеччину у Першій світовій війні. Перед останньою великою депортацією 1 вересня 1942 року 40 чоловіків і жінок єврейського походження наклали на себе руки. У березні 1945 року, коли Аушвіц вже був звільнений, група так званих дітей змішаної крові з Вісбадена була депортована до Терезієнштадта разом з їхніми батьками-євреями.

Кількість жертв Голокосту з Вісбадена, тобто євреїв, які були депортовані з Вісбадена або народилися у Вісбадені, але були депортовані з іншого німецького або іноземного міста і вбиті в таборі знищення, включаючи тих, хто наклав на себе руки через переслідування або неминучу депортацію, становить щонайменше 1 500 осіб, у тому числі щонайменше 120 єврейських дітей і молоді.