Націонал-соціалізм ставив собі за головну мету створення "справжньої національної спільноти". З цією метою всі незалежні інституції та об'єднання мали бути або приведені у відповідність, або розпущені. Якщо Католицьку Церкву було "умиротворено" шляхом укладення конкордату в липні 1933 року, то Протестантську Церкву потрібно було привести у відповідність.

За досягнення цієї мети в Берліні відповідали два юристи з Вісбадена: державний секретар Міністерства культури Пруссії Вільгельм Штукарт і колишній суддя Вісбаденського окружного суду Август Єгер. Обидва спочатку досягли успіху. За особистої підтримки Гітлера їм вдалося захопити владу в більшості протестантських регіональних церков. На загальнонаціональних "церковних виборах" 22 липня 1933 року більшість церковних рад і синодів заповнили націонал-соціалісти і "німецькі християни", церковна партія прихильників НСДАП.

Оскільки нацистська держава в той час була надзвичайно прихильною до церкви, спротиву майже не було. Ситуація змінилася лише тоді, коли синоди прийняли "арійський параграф" з Рейхсгаузу про відновлення професійної державної служби від 7 квітня 1933 року, згідно з яким лише "чисто арійські" пастори - без єврейських батьків, дідів чи бабусь - могли служити в церкві. Лише один пастор, Карл Амборн (1890-1952) з Браубаха, заперечив проти цього рішення на "Brauner Landeskirchentag" Євангелічної церкви Нассау 12 вересня 1933 року у Вісбадені, але 60 пасторів вже підписали за день до цього в Берліні зобов'язання "Pfarrernotbund". У ній вони пообіцяли захищати церкву від зовнішнього впливу і заступатися за своїх колег-служителів, яких торкнулися синодальні постанови.

У наступні роки "Pfarrernotbund" перетворився на кістяк церковної опозиції, а його лідером став пастор Мартін Німьоллер. За кілька тижнів до організації приєдналося кілька тисяч пасторів, у тому числі й деякі пастори у Вісбадені. На противагу цьому, об'єднання німецьких християн у Нассау до кінця 1933 року повністю розпалися. Цьому сприяв і той факт, що регіональний церковний з'їзд під головуванням Августа Єгера в негідний спосіб змістив з посади регіонального єпископа Нассау Августа Кортхойєра.

Найважливішим рішенням регіонального церковного з'їзду стало об'єднання Євангельської Церкви Нассау з двома регіональними церквами Гессен-Дармштадт і Франкфурт-на-Майні. Гессен-Кассель в останній момент скасував об'єднання. У новій регіональній церкві, яка отримала назву Нассау-Гессен, Гессен-Дармштадт претендував на провідну роль. На першому об'єднаному синоді було запропоновано кандидатуру гессенського прелата Вільгельма Діля (1871-1944), а також 36-річного пастора вісбаденської ринкової церкви Ернста Людвіга Дітріха. Це ім'я викликало запеклі протести в усіх трьох регіональних церквах. Тим не менш, 8 лютого 1934 року Дітріх був призначений єпископом Нассау-Гессен рейхсратом Людвігом Мюллером. Він виконував свої обов'язки за допомогою заборон і покарань і користувався сильною підтримкою Берліна і регіонального партійного керівництва в своєму управлінні.

У першій половині 1934 року церковна опозиція значно зросла. Після конфесійного синоду в Бармені (29-31 травня 1934 р.) повсюдно, в тому числі і в Нассау-Гессені, виникли конфесійні спільноти, в яких об'єднувалися не тільки опозиційні пастори, а й парафіяни і цілі громади. На конфесійному синоді в Далемі в жовтні 1934 року опозиція нарешті офіційно заявила про свою непокору незаконному церковному режиму і закликала громади підкоритися конфесійному синоду. У Нассау-Гессені також велика кількість пасторів і громад заявили про своє неприйняття Рейху і церковних урядів земель. Було засновано регіональну братську раду, яка діяла як регіональне надзвичайне церковне керівництво для конфесійних громад. Церковна політика нацистського уряду зазнала невдачі.

Гітлер скасував урочистий прийом регіональних єпископів і церемонію приведення до присяги єпископа Рейху; Август Єгер, головний герой Gleichschaltung, був звільнений з усіх своїх посад. Спроба примусити регіональні церкви до об'єднання в єдину Рейхсцеркву на офіційному рівні спрацювала для деяких з них, наприклад, у Нассау-Гессені, але протестантська церква розпалася на шматки. Про те, наскільки постраждав уряд Рейху, свідчить "Вісбаденська промова", виголошена міністром внутрішніх справ Рейху Вільгельмом Фріком (1877-1946) 7 грудня 1934 року, в якій він заявив, що в церковній опозиції збираються "антидержавні і зрадницькі елементи", і назвав суперечки "сваркою пасторів".

Разом з іншими Штукарт представив свою концепцію майбутньої церковної політики. Гітлер призначив його статс-секретарем у рейхсміністерстві внутрішніх справ. Згідно з пропозицією Штукарта, рейхсвер мав утриматися від впровадження принципу фюрера в церкві, але церковна адміністрація мала стати об'єктом більшого контролю. Було створено нове Міністерство у справах церкви під керівництвом Ганса Керрля (1887-1941). Він створив Рейхскомітет у справах церкви з більш-менш нейтральних осіб, а також регіональні церковні комітети у "зруйнованих церквах", до яких належав і Нассау-Гессен. Єпископ Дітріх був змушений скласти свої повноваження; він зберіг лише свій титул. Регіональний церковний комітет намагався пом'якшити деякі каральні заходи часів Дітріха. Ця друга фаза суперечок принесла лише зовнішнє заспокоєння. Сповідницька Церква не визнавала розпоряджень церковних комітетів, призначених державою.

Третя фаза конфлікту почалася в Нассау-Гессені в середині 1937 року з міністерського наказу: попередній керівник регіонального церковного управління, президент Пауль Кіппер, був призначений одноосібним керівником регіональної церкви. Колишній суддя Вісбаденського окружного суду Кіппер очолив церковну адміністрацію в Дармштадті в 1934 році і пристосувався до нацистської системи.

Однак, оскільки в цей час націонал-соціалізм став відверто ворожим до церков і християнства, конфлікти продовжувалися. Навіть під час війни державні репресії проти Церкви жодним чином не зменшилися. Пасторів, у тому числі священнослужителів з Нассау, відправляли до концентраційних таборів. У церквах було заборонено релігійне навчання, з парафій були вилучені дитячі садки, в лікарнях більше не дозволялося здійснювати хрещення, пасторам дозволялося відвідувати хворих у лікарнях лише на їхнє прохання. Однак найрадикальнішим заходом 1939 року стало відокремлення "расово єврейських християн" не лише від конгрегацій, але й від протестантської церкви загалом. Президент Кіпер підписав відповідне звернення. Ландесбрудеррат рішуче протестував - безуспішно.

З січня 1939 року різні церковні групи об'єдналися в "Об'єднавчу організацію Нассау-Гессен". Її лідерами стали Фрідріх Мюллер (1879-1947) з Дармштадта як представник "Центру", групи тих, хто не визначився, пастор Карл Вайдт від Сповідницької церкви та єпископ Дітріх як представник "Регіональних церков", як називала себе група під його керівництвом. Дітріх публічно відмежувався від свого попереднього шляху і пошкодував про всі заходи, які серйозно вплинули на його колег-служителів. Однак навіть об'єднавча організація не змогла спрямувати нацистський курс церковної влади в інше русло.

Боротьба навколо питання про те, який вплив держава повинна мати на життя Церков, вилилася у своєрідний опір державній політиці, якого багато хто з її учасників спочатку не бажав. Це призвело до того, що західні союзники визнали Ісповідницьку Церкву групою опору після розпаду Радянського Союзу, хоча вона насправді не хотіла бути такою.