Nasyonal Sosyalizmin temel hedeflerinden biri "gerçek bir ulusal topluluk" yaratmaktı. Bu amaçla, tüm bağımsız kurumlar ve dernekler ya hizaya getirilecek ya da feshedilecekti. Katolik Kilisesi Temmuz 1933'te imzalanan bir konkordato ile "pasifize" edilirken, Protestan Kilisesi de hizaya getirilecekti.

Wiesbaden'den iki avukat Berlin'de bu hedefe ulaşmakla görevliydi: Prusya Kültür Bakanlığı Devlet Sekreteri Wilhelm Stuckart ve eski Wiesbaden Bölge Mahkemesi Yargıcı August Jäger. Her ikisi de başlangıçta başarılı oldu. Hitler'in kişisel desteğiyle Protestan bölge kiliselerinin çoğunda iktidarı ele geçirmeyi başardılar. Ülke çapında 22 Temmuz 1933'te yapılan bir "kilise seçiminde" kilise konseylerinin ve sinodların çoğunluğu Nasyonal Sosyalistler ve NSDAP'nin kilise partisi destekçileri olan "Alman Hıristiyanlar" ile dolduruldu.

Nazi devleti o dönemde son derece kilise dostu olduğu için neredeyse hiç direniş olmadı. Bu durum ancak sinodlar, 7 Nisan 1933 tarihli Profesyonel Kamu Hizmetinin Yeniden Yapılandırılmasına İlişkin Reich Yasası'ndaki "Aryan paragrafını" kabul ettiğinde değişti; buna göre sadece "saf Aryan" papazların - Yahudi bir ebeveyni veya büyük ebeveyni olmayan - kilisede görev yapmasına izin veriliyordu. Braubach'tan sadece bir papaz, Karl Amborn (1890-1952), 12 Eylül 1933'te Wiesbaden'de Nassau Evanjelik Kilisesi'nin "Brauner Landeskirchentag" toplantısında bu karara itiraz etti, ancak 60 papaz bir gün önce Berlin'de "Pfarrernotbund" taahhütnamesini imzalamıştı. Bu taahhütnamede kiliseyi dış etkilere karşı koruyacaklarına ve sinod kararlarından etkilenen papaz arkadaşlarını savunacaklarına söz veriyorlardı.

Sonraki yıllarda Pfarrernotbund kilisenin muhalefetinin belkemiği haline geldi; lideri Pastör Martin Niemöller'di. Birkaç hafta içinde, aralarında Wiesbaden'deki bazı papazların da bulunduğu birkaç bin papaz bu örgüte katıldı. Buna karşılık, Nassau'daki Alman Hıristiyanların dernekleri 1933'ün sonunda tamamen dağılmıştı. Bunda August Jäger başkanlığındaki bölgesel kilise kongresinin Nassau bölge piskoposu August Kortheuer 'i layık olmadığı bir şekilde görevinden uzaklaştırmasının da payı vardı.

Bölgesel kilise kongresinin en önemli kararı Nassau Evanjelik Kilisesi'nin iki bölgesel kilise olan Hessen-Darmstadt ve Frankfurt am Main ile birleşmesiydi. Hessen-Kassel birleşmeyi son anda iptal etti. Nassau-Hessen adını alan yeni bölgesel kilisede Hessen-Darmstadt liderlik görevini üstlendi. İlk ortak sinodda, Wiesbaden Marktkirche'nin 36 yaşındaki papazı Ernst Ludwig Dietrich'in yanı sıra Hessen başpapazı Wilhelm Diehl (1871-1944) önerildi. Bu isim her üç bölge kilisesinde de şiddetli protestolara neden oldu. Buna rağmen Dietrich, 8 Şubat 1934 tarihinde Reich Piskoposu Ludwig Müller tarafından Nassau-Hesse Piskoposu olarak atandı. Görevini yasaklar ve cezalarla yürüttü ve yönetiminde Berlin ve bölgesel parti liderliği tarafından güçlü bir şekilde desteklendi.

1934'ün ilk yarısında kilise muhalefeti önemli ölçüde artmıştı. Barmen'deki günah çıkarma sinodundan (29-31 Mayıs 1934) bu yana, Nassau-Hesse de dahil olmak üzere her yerde, sadece muhalif papazların değil, aynı zamanda cemaat üyelerinin ve tüm cemaatlerin birleştiği günah çıkarma toplulukları ortaya çıkmıştı. Ekim 1934'te Dahlem'deki günah çıkarma sinodunda, muhalefet nihayet resmi olarak yasadışı kilise rejimine itaatsizliğini ilan etti ve cemaatleri bunun yerine günah çıkarma sinoduna boyun eğmeye çağırdı. Nassau-Hesse'de de çok sayıda papaz ve cemaat Reich ve eyalet kilise yönetimlerini reddettiklerini ilan etti. İtirafçı cemaatler için bölgesel bir acil durum kilise liderliği olarak hareket eden bölgesel bir kardeşlik konseyi kuruldu. Nazi hükümetinin kilise politikası başarısız olmuştu.

Hitler, bölgesel piskoposların görkemli bir şekilde ilan edilen kabulünü ve Reich piskoposunun yemin törenini iptal etti; Gleichschaltung'un ana kahramanı August Jäger tüm görevlerinden alındı. Bölgesel kiliseleri birleşik bir Reich Kilisesi'ne zorlama girişimi, Nassau Hessen'de olduğu gibi bazılarında resmi düzeyde işe yaramıştı ama Protestan Kilisesi parçalanmıştı. Reich hükümetinin ne ölçüde etkilendiği, Reich İçişleri Bakanı Wilhelm Frick'in (1877-1946) 7 Aralık 1934'te yaptığı "Wiesbaden Konuşması" ile ortaya çıkmıştır; Frick konuşmasında "devlet karşıtı ve hain unsurların" kilise muhalefeti içinde toplandığını iddia etmiş ve anlaşmazlıkları "papazların kavgası" olarak nitelendirmiştir.

Stuckart diğerleriyle birlikte gelecekteki kilise politikası için kendi konseptini sundu. Hitler onu Reich İçişleri Bakanlığı'na Devlet Sekreteri olarak atadı. Stuckart'ın önerisine göre, Reich hükümeti kilisede Führer ilkesini uygulamaktan kaçınacak, ancak kilise yönetimi daha fazla kontrole tabi olacaktı. Hanns Kerrl (1887-1941) liderliğinde yeni bir Kilise İşleri Bakanlığı kuruldu. Az çok tarafsız kişilerden oluşan bir Reich Kilise Komitesi ve Nassau-Hesse'nin de dahil olduğu "yıkılmış kiliselerde" bölgesel kilise komiteleri kurdu. Piskopos Dietrich yetkilerinden feragat etmek zorunda kaldı; sadece unvanını korudu. Bölgesel kilise komitesi Dietrich'in zamanından kalma bazı cezalandırıcı önlemleri hafifletmeye çalıştı. Anlaşmazlıkların bu ikinci aşaması sadece dışsal bir pasifikasyon getirdi. İtirafçı Kilise, devlet tarafından atanan kilise komitelerinin emirlerini tanımadı.

Anlaşmazlığın üçüncü aşaması 1937 yılının ortalarında Nassau-Hesse'de bir bakanlık emriyle başladı: Bölgesel kilise dairesinin önceki başkanı Başkan Paul Kipper, bölgesel kilisenin tek başkanı olarak atandı. Eski Wiesbaden bölge mahkemesi hakimi olan Kipper, 1934 yılında Darmstadt'taki kilise idaresinin başına geçmiş ve Nazi sistemine uyum sağlamıştı.

Ancak Nasyonal Sosyalizm bu dönemde kiliselere ve Hıristiyanlığa karşı belirgin bir düşmanlık beslemeye başlayınca çatışmalar da devam etti. Savaş sırasında bile kiliseye yönelik devlet baskısı hiçbir şekilde azalmadı. Aralarında Nassau'lu din adamlarının da bulunduğu papazlar toplama kamplarına gönderildi. Kiliselerde dini eğitim verilmesine izin verilmedi; kilise cemaatleri anaokullarından mahrum bırakıldı; vaftiz törenlerinin hastanelerde yapılmasına artık izin verilmedi; papazların hastanelerdeki hastaları ziyaret etmelerine ancak kendilerinden talep edilmesi halinde izin verildi. Ancak 1939'daki en radikal önlem, "ırksal olarak Yahudi olan Hıristiyanların" sadece cemaatlerden değil, genel olarak Protestan kilisesinden ayrılmasıydı. Başkan Kipper ilgili çağrıyı birlikte imzalamıştı. Landesbruderrat bunu şiddetle protesto etti ama başarılı olamadı.

Ocak 1939'dan beri çeşitli kilise grupları birleşerek "Nassau-Hessen Birleşme Örgütü "nü oluşturmuştu. Liderler, yeni oluşan kararsızlar grubu "Merkez "in temsilcisi olarak Darmstadt'tan Friedrich Müller (1879-1947), İtirafçı Kilise adına Papaz Karl Veidt ve onun liderliğindeki grubun kendisini adlandırdığı şekliyle "Bölgesel Kiliseler "in temsilcisi olarak Piskopos Dietrich idi. Dietrich daha önceki yolundan açıkça uzaklaşmış ve papaz arkadaşlarını ciddi şekilde etkileyen tüm önlemlerden pişmanlık duymuştu. Ancak, birleşme örgütü bile kilise yetkililerinin Nazi rotasını farklı bir yöne çeviremedi.

Devletin kiliselerin yaşamı üzerinde nasıl bir etkiye sahip olması gerektiği sorusu üzerine verilen mücadele, devlet politikasına karşı bir tür direnişle sonuçlanmıştı ki, burada yer alanların çoğu başlangıçta bunu istememişti. Bu durum, Batılı Müttefiklerin, çöküşten sonra, aslında bir direniş grubu olmak istememiş olsa da, İtirafçı Kilise'yi bir direniş grubu olarak tanımasına yol açmıştır.