Учредители на фондация "Мартин Ниймьолер", създадена на 15 януари 1977 г., са социологът Ойген Когон и теологът Хайнц Клопенбург. Мартин Ниймьолер с удоволствие дава съгласието си асоциацията, която смята за своя задача да насърчава разбирателството, разведряването и мира, да бъде наречена на негово име. Изключителни събития в историята на асоциацията през първите години са мирните преговори в Москва през 1982 г., колоквиумът "Един свят или никой" през 1986 г. и големият конгрес за мир през 1988 г. През 1991 г. офисът се премества от Кьолн във Висбаден

Днес фондация "Мартин Ниймьолер" се концентрира върху организирането на събития и конференции в района на Висбаден и Рейн-Майн. Редовно сътрудничество съществува например в поредицата от събития "27 януари - памет и възпоменание" и с протестантската енория Бергкирхе, където понастоящем се намира седалището на фондацията. Други партньори за сътрудничество са Активният музей Шпигелгасе за германско-еврейска история, Дружеството за християнско-еврейско сътрудничество и протестантското деканство във Висбаден.

С проекта "Перемоха" фондация "Мартин Ниймьолер" подкрепя едно от многото села в Украйна, опожарени от германски войници по време на Втората световна война. Фондация "Мартин Ниймьолер" присъжда наградата "Юлиус Румпф" на личности или групи, които са се ангажирали с толерантността и ненасилието. Наградата е дарена от д-р Гюнтер и Ингрид Румпф и има за цел да увековечи паметта на пазарджишкия църковен пастор Юлиус Румпф. Основна грижа на сдружението е също така да събуди спомена за личността и делото на живота на Мартин Ниймьолер. По тази причина сдружението от много години работи съвместно с училището "Мартин Ниемьолер" във Висбаден.

Председатели на фондация "Мартин Нимьолер" са били Хайнц Клопенбург (1980-86 г.), Ойген Когон (1986-90 г.), Валтер Йенс (1990-95 г.), Мартин Щор (1995-2010 г.) и Михаел Карг (от 2010 г.).