Membrii fondatori ai Fundației Martin Niemöller, care a fost înființată la 15 ianuarie 1977, au fost sociologul Eugen Kogon și teologul Heinz Kloppenburg. Martin Niemöller a fost bucuros să își dea acordul pentru ca asociația, care își propune să promoveze înțelegerea, destinderea și pacea, să poarte numele său. Evenimentele marcante din istoria asociației din primii ani au fost negocierile de pace de la Moscova din 1982, colocviul "One World or None" din 1986 și marele congres pentru pace din 1988. În 1991, biroul s-a mutat din Köln la Wiesbaden

În prezent, Fundația Martin Niemöller se concentrează pe organizarea de evenimente și conferințe în zona Wiesbaden și în regiunea Rin-Main. Există o cooperare regulată, de exemplu, în seria de evenimente "27 ianuarie - Remembering and Commemorating" și cu parohia protestantă Bergkirche, unde se află în prezent sediul fundației. Alți parteneri de cooperare sunt Muzeul activ Spiegelgasse pentru istoria evreilor germani, Societatea pentru cooperare creștin-evreiască și Decanatul protestant din Wiesbaden.

Prin proiectul "Peremoha", Fundația Martin Niemöller sprijină unul dintre numeroasele sate din Ucraina incendiate de soldații germani în timpul celui de-al Doilea Război Mondial. Fundația Martin Niemöller acordă Premiul Julius Rumpf persoanelor sau grupurilor care se angajează pentru toleranță și non-violență. Premiul a fost donat de Dr. Günther și Ingrid Rumpf și este destinat comemorării pastorului bisericii de piață Julius Rumpf. Este, de asemenea, o preocupare centrală a asociației să evoce amintirea personalității și a activității lui Martin Niemöller. Din acest motiv, asociația colaborează de mulți ani cu Școala Martin Niemöller din Wiesbaden.

Președinții Fundației Martin Niemöller au fost Heinz Kloppenburg (1980-86), Eugen Kogon (1986-90), Walter Jens (1990-95), Martin Stöhr (1995-2010) și Michael Karg (din 2010).