Werner Egk, Werner Joseph Mayer olarak 17 Mayıs 1901'de bugün Donauwörth'e bağlı olan Auchsesheim'da doğdu. Egk takma adı, 1923'te evlendiği eşinin baş harflerinden oluşan bir anagramdır ve besteci tarafından 1937'den itibaren resmi soyadı olarak kullanılmıştır.

Henüz okuldayken şan ve piyano eğitimi aldıktan sonra Frankfurt am Main'da ve daha sonra Münih'te Carl Orff ile kompozisyon ve orkestra şefliği çalıştı.

Nasyonal Sosyalist dönemde devletin en önemli bestecilerinden biri haline gelen Egk, İkinci Dünya Savaşı'ndan sonra 1950'den 1953'e kadar Batı Berlin'deki "Hochschule für Musik "in müdürü olarak çalıştı. 1970'lere kadar çeşitli ulusal ve uluslararası orkestra şefliği organizasyonlarında aktif olarak yer aldı.

Müzikal çalışmaları Alman neoklasizmine ve modern müzik tiyatrosuna atfedilir. Birçok opera, bale ve orkestra eserinin yanı sıra vokal müziği, müzikal komediler ve 1948 yapımı Heinz Rühmann filmi "Der Herr vom anderen Stern" için film müziği bestelemiştir.

Egk'in 80. doğum günü vesilesiyle Wiesbaden'de onuruna bir konser düzenlendi. Bu ziyaret sırasında besteci belediye meclisi tarafından belediye binasında kabul edildi ve kentin Altın Kitabı'nı imzaladı.

Werner Egk 10 Temmuz 1983'te Inning am Ammersee'de öldü.