Wiesbaden a fost numit "Aquae Mattiacorum" de către romani - după Mattiacs, un trib de Chatti germanici care a trăit aici și ai cărui membri s-au amestecat probabil cu populația celtică originală de timpuriu. Urme de așezări în zona orașului au fost documentate încă din perioada neolitică, în jurul anului 3000 î.Hr. Un prim post militar (fort de pământ) pe Heidenberg poate fi datat în perioada augustană târzie, între 6 și 15 d.Hr.; dezvoltarea unei așezări civile romane a început puțin mai târziu, odată cu extinderea băilor termale. Aceasta a fost fortificată cu un zid în jurul anului 370 - rămășițele acestui așa-numit Heidenmauer pot fi văzute și astăzi.

La sfârșitul secolului al IV-lea, germanii au preluat protecția orașului Wiesbaden ca cap de pod pentru Mainz, iar aproximativ un secol mai târziu francii au început să colonizeze zona. Orașul era deja sediul unei curți regale în epoca merovingiană și a fost denumit pentru prima dată "Wisabada" în 828/30. Din Evul Mediu târziu, Wiesbaden a aparținut conților de Nassau. În secolul al XIII-lea, a fost temporar un oraș imperial până la distrugerea sa de către arhiepiscopul de Mainz în 1242. În 1547 și 1561, incendiile au distrus aproape toate clădirile medievale. Războiul de treizeci de ani a avut, de asemenea, efecte devastatoare. Cu toate acestea, începând cu 1690, orașul, care avea doar aproximativ 730 de locuitori la acea vreme, a fost extins și fortificat din nou. În 1744, prințul Karl von Nassau-Usingen și-a mutat reședința în palatul Biebrich; Wiesbaden a devenit sediul guvernului principatului, ulterior ducat de Nassau (1806-1866).

În secolul al XIX-lea, orașul a devenit o stațiune balneară internațională. Anexarea orașului Nassau de către Prusia în 1866 nu a împiedicat cu nimic ascensiunea orașului Wiesbaden. Wiesbaden a devenit capitala unui district guvernamental și o casă de odihnă preferată pentru ofițeri, înalți funcționari publici și pensionari care trăiau din pensiile lor sau din dobânzile la activele lor. Peisajul urban era caracterizat de clădiri rezidențiale de prestigiu, palate hoteliere și vile elegante. Populația a crescut rapid și a depășit 100 000 de locuitori în 1905.

Primul Război Mondial, ocupația franceză și britanică care a urmat până în 1930 și Marea Depresiune au slăbit considerabil puterea financiară a orașului; chiar și încorporarea suburbiilor în 1926 și 1928 nu a făcut mare lucru pentru a schimba această situație. Wiesbaden și-a pierdut importanța de odinioară ca "oraș balnear mondial".

Numeroase birouri ale regimului nazist al nedreptății s-au aflat în Wiesbaden începând cu 1933. De asemenea, evreii și sinti au fost deportați de aici. Mulți locuitori din Wiesbaden de diferite culori politice au fost persecutați pentru că s-au opus regimului.

După ce a suferit relativ puține pagube în timpul celui de-al Doilea Război Mondial, Wiesbaden a devenit capitala landului Hesse în 1945, unde numeroase edituri, companii de asigurări și întreprinderi din industria cinematografică, printre altele, s-au stabilit alături de birourile guvernamentale. Wiesbaden joacă, de asemenea, un rol important ca oraș balnear și de congrese și ca unul dintre locurile preferate pentru a trăi în regiunea Rin-Main.