Od końca III wieku do początku V wieku naszej ery Breckenheim było miejscem wczesnohalamańskiej osady. Opierając się na nazwie miejsca, prawdopodobna jest frankijska fundacja od VI do IX wieku, podobnie jak w przypadku Delkenheim. Breckenheim zostało po raz pierwszy wspomniane 1 maja 950 roku w dyplomie króla Ottona I; od 1137 roku Breckenheim należało do panów Eppstein. Breckenheim było jedną z najbogatszych wiosek w ich dominium; mieli tu ufortyfikowaną farmę, która prawdopodobnie obejmowała młyn wspomniany w 1300 roku. Ważnymi kościelnymi właścicielami ziemskimi byli kapituła katedralna w Moguncji, opactwo Mariackie i opactwo Bleidenstadt.

Podobnie jak inne wioski w Ländchen, B. zostało uwikłane w konflikty między hrabiami Nassau i panami Eppstein na początku XV wieku; wioska została spalona w wyniku waśni pod koniec 1417 roku. Zastawiony przez Eppsteinerów hrabiom Palatynatu Renu w latach 1480/88, Breckenheim ostatecznie przeszedł do landgrafatu Hesji wraz z resztą "Ländchen" w 1492 roku.

Pierwsza wzmianka o kaplicy w Breckenheim pochodzi z 15 maja 1251 roku; była ona poświęcona św. Mikołajowi i stała się niezależnym kościołem parafialnym w 1310 roku. W 1655 r. Medenbach i związane z nim Wildsachsen były filią Breckenheim. Oddzielenie nastąpiło dopiero w 1984 r. W 1530 r. wprowadzono reformację. Kościół został zniszczony w pożarze, który zniszczył większość wioski w 1638 roku; przetrwała tylko romańska wieża kościelna. W latach 1720-24 zbudowano nowy barokowy kościół halowy i odnowiono wieżę. Kościół stanowił centrum wsi. Przed nim obradował sąd, o którym pierwsze wzmianki pochodzą z 1300 roku. Przewodniczył mu Schultheiß, mianowany przez mieszkańców Eppstein; sprawował on władzę sądowniczą i karną we wsi. Pomagało mu 16 dingleute w 1368 roku i pięciu wójtów w 1375 roku. Sąd okręgowy w Mechtildshausen był odpowiedzialny za sądownictwo krwi. Pieczęć sądu z 1729 r. przedstawia św. Michała z mieczem w prawej ręce i wagą w lewej.

Breckenheim było ważną społecznością winiarską w późnym średniowieczu; wioska dostarczała wino mszalne dla opactwa Bleidenstadt. Jednak po wojnie trzydziestoletniej uprawa winorośli podupadła; ludzie próbowali poprawić przygnębiającą sytuację gospodarczą, uprawiając tytoń i owoce, produkując ocet owocowy, hodując owce i handlując wełną. Pierwsza wzmianka o hodowli owiec pochodzi z 1570 roku. W 1614 r. istniała hodowla owiec i młyn, który landgraf Moritz pożyczył zarządcy poczty we Frankfurcie. Olejarnia, Klingenmühle, została zbudowana w 1745 roku i działała do 1900 roku. Młyn zbożowy "Lochmühle" istniał w latach 1846-94.

W 1592 r. Breckenheim miało 43 domy i 160 mieszkańców. Wiele osób padło ofiarą wojny trzydziestoletniej i zarazy, a w 1638 r. wieś liczyła tylko ośmiu mieszkańców. Wieś została poważnie zdewastowana. Niezależne wioski Harpach i Costloff z 10 rodzinami między Breckenheim i Medenbach również zostały zrównane z ziemią i nigdy nie zostały odbudowane. Do 1668 r. w Breckenheim ponownie osiedliło się 30 rodzin.

W 1665 roku po raz pierwszy słyszymy o warunkach szkolnych. W tym roku proboszcz zażądał pieniędzy na pensję dla nauczyciela. Około 1690 r. w stodole dziesięcinnej utworzono pierwszą klasę. Do tego czasu dzieci musiały chodzić do szkoły w Wallau. W 1724 r. zbudowano pierwszą "prawdziwą" szkołę w większym budynku z dwiema salami lekcyjnymi i mieszkaniem dla nauczyciela; burmistrz miał również swoje biura w tym budynku. Wraz z wprowadzeniem obowiązku szkolnego w 1755 r., wykwalifikowany nauczyciel po raz pierwszy przejął nauczanie; pełnił on również funkcję organisty, sekstansa i dzwonnika. Drugie stanowisko nauczyciela zostało utworzone w 1845 roku. Nowa szkoła została zbudowana na Mönchacker w 1938 roku. Stara szkoła służyła jako ratusz do 1966 roku; budynek został zburzony w 1967 roku. W 1750 r. Breckenheim uzyskało lepsze zaopatrzenie w wodę dzięki wywierceniu dziewięciu studni. Breckenheim miało stosunkowo dużą populację żydowską: w 1794 r. wynosiła ona około 5%. W 1831 r. książę Wilhelm zu Nassau wydał list ochronny Żydowi Salomonowi z Breckenheim. W 1843 r. 32 z 707 mieszkańców było Żydami. W 1859 r. żydowscy mieszkańcy Langenhain, Medenbach i Wildsachsen również należeli do gminy żydowskiej w Breckenheim. Rodzina Adolfa i Rosy Kahn około 1900 roku prowadziła we wsi przedsiębiorstwo zajmujące się produkcją owoców i paszy dla zwierząt; Adolf Kahn był jednym z założycieli towarzystwa chóralnego "Eintracht", które powstało w 1885 roku. Breckenheim stało się częścią Nassau wraz z poselstwem cesarskim w 1803 roku, a następnie Prus w 1866 roku.

Od lat trzydziestych XIX wieku rozbudowywano lokalne drogi i autostradę do Igstadt. Po wielu petycjach w 1804 r. wybudowano nową plebanię, a w 1845 r. utworzono drugą placówkę oświatową. Straż pożarna istniała w wiosce od 1763 roku. Breckenheim zostało podłączone do sieci elektrycznej w 1911 roku. W latach 1928/29 miejscowość otrzymała nowoczesny wodociąg. Od 1927 r. istniało miejskie połączenie autobusowe z Breckenheim do Bierstadt; stamtąd można było dojechać tramwajem elektrycznym do Wiesbaden.

Breckenheim pozostało wioską rolniczą do lat 50-tych XX wieku, ale rolnictwo nie było już głównym źródłem dochodu mieszkańców. Coraz więcej mieszkańców Breckenheim zajmowało się krawiectwem, a przede wszystkim budownictwem. Dodatkowym źródłem dochodu były dostawy mleka do pobliskiego uzdrowiska. Pierwsze kluby powstały w wiosce w latach osiemdziesiątych XIX wieku: stowarzyszenie chóralne "Eintracht" w 1885 roku, klub gimnastyczny Breckenheim w 1890 roku, klub hodowli drobiu w 1907 roku, klub straży pożarnej w 1910 roku, klub rowerowy Solidarität w 1912 roku i stowarzyszenie chóralne "Frohsinn" w 1922 roku. W pierwszej wojnie światowej zginęły 24 osoby, którym po wycofaniu się francuskich okupantów w 1923 r. postawiono pomnik przed kościołem. Społeczność przetrwała II woj nę światową w dużej mierze bez szwanku, z wyjątkiem 64 poległych i zaginionych.

Po II wojnie światowej populacja znacznie wzrosła z powodu napływu przesiedleńców (1939: 826 mieszkańców; 1946: 1065 mieszkańców; 1950: 1142 mieszkańców). W latach sześćdziesiątych Breckenheim stało się ulubionym miejscem zamieszkania. Dla osób z Wiesbaden, Moguncji i Frankfurtu, które chciały się budować, wyznaczono duże obszary budowlane, początkowo "Auf der Ahl" i obszar "Die Weinberge", później dodano "Prügelwiese" i "Prügelgärten". W 1965 r. wybudowano wielofunkcyjny budynek mieszczący ratusz, remizę strażacką i siedem mieszkań. Do 1980 r. liczba ludności potroiła się. W 2014 roku Breckenheim liczyło około 3300 mieszkańców.

W latach sześćdziesiątych XX wieku wioska otrzymała herb oparty na starej pieczęci sądowej, która przedstawia pionowy srebrny miecz ze złotą rękojeścią i złotymi łuskami w kolorze czerwonym. W 1974 r. władze miejskie zdecydowały, że Breckenheim powinno zostać włączone do Wiesbaden. W dniu 21 czerwca 1974 r. heski parlament zatwierdził ten wniosek, a przyłączenie nastąpiło 1 stycznia 1977 r.