De la sfârșitul secolului al III-lea până la începutul secolului al V-lea d.Hr., Breckenheim a fost locul unei așezări halahannice timpurii. Pe baza toponimului, este probabilă o fundație francă din secolul al VI-lea până în secolul al IX-lea, ca și în cazul Delkenheim. Breckenheim a fost menționat pentru prima dată la 1 mai 950 într-o diplomă a regelui Otto I; din 1137, Breckenheim a aparținut lorzilor din Eppstein. Breckenheim a fost unul dintre cele mai bogate sate din stăpânirea lor; ei au avut aici o fermă fortificată, care includea probabil o moară menționată în 1300. Printre proprietarii ecleziastici importanți se numărau Capitlul Catedralei Mainz, Abația Sfânta Maria și Mănăstirea Bleidenstadt.

Ca și alte sate din Ländchen, B. a fost prins în disputele dintre conții de Nassau și domnii de Eppstein la începutul secolului al XV-lea; satul a fost incendiat în timpul unei dispute la sfârșitul anului 1417. Dăruit de Eppsteiners conților palatini ai Rinului în 1480/88, Breckenheim a trecut în cele din urmă la Landgraviate de Hesse împreună cu restul "Ländchen" în 1492.

O capelă în Breckenheim a fost menționată pentru prima dată la 15 mai 1251; aceasta a fost dedicată Sfântului Nicolae și a devenit o biserică parohială independentă în 1310. În 1655, Medenbach și Wildsachsen asociate erau o ramură a Breckenheim. Separarea nu a avut loc până în 1984. Reforma a fost introdusă în 1530. Biserica a fost distrusă într-un incendiu care a distrus cea mai mare parte a satului în 1638; doar turnul bisericii romanice a supraviețuit. Între 1720-24, a fost construită o nouă biserică-sală barocă, iar turnul a fost renovat. Biserica a fost centrul satului. Curtea, menționată pentru prima dată în 1300, se întrunea în fața ei. Era prezidată de Schultheiß, care era numit de oamenii din Eppstein; acesta exercita puterea de comandă și dreptul penal în sat. El era asistat de 16 dingleute în 1368 și de cinci consilieri în 1375. Curtea districtuală din Mechtildshausen era responsabilă de jurisdicția sângelui. Un sigiliu al instanței din 1729 îl înfățișează pe Sfântul Mihail cu o sabie în mâna dreaptă și solzi în mâna stângă.

Breckenheim a fost o comunitate viticolă importantă în Evul Mediu târziu; satul furniza vinul de masă pentru abația Bleidenstadt. Cu toate acestea, după Războiul de treizeci de ani, viticultura a scăzut; oamenii au încercat să îmbunătățească situația economică deprimantă prin cultivarea tutunului și a fructelor, producerea oțetului din fructe, creșterea oilor și comerțul cu lână. O fermă de oi este menționată pentru prima dată în 1570. În 1614 existau o fermă de oi și o moară, pe care Landgraful Moritz le împrumutase unui administrator poștal din Frankfurt. O moară de ulei, Klingenmühle, a fost construită în 1745 și a funcționat până în 1900. "Lochmühle", o moară de cereale, a existat din 1846-94.

În 1592, Breckenheim avea 43 de case și 160 de locuitori. Mulți oameni au căzut victime Războiului de Treizeci de Ani și ciumei, iar satul avea doar opt locuitori în 1638. Satul a fost grav devastat. Satele independente Harpach și Costloff, cu 10 familii între Breckenheim și Medenbach, au fost, de asemenea, rase de pe fața pământului și nu au mai fost reconstruite niciodată. Până în 1668, 30 de familii se stabiliseră din nou în Breckenheim.

În 1665 auzim pentru prima dată despre condițiile școlare. În acest an, preotul paroh a cerut bani pentru salariul unui director de școală. În jurul anului 1690, prima sală de clasă a fost amenajată într-un hambar de zeciuială. Până atunci, copiii trebuiau să meargă la școală în Wallau. În 1724, prima școală "adevărată" a fost construită într-o clădire mai mare, cu două săli de clasă și un apartament pentru învățători; în această clădire își avea birourile și primarul. Odată cu introducerea învățământului obligatoriu în 1755, un învățător calificat a preluat pentru prima dată predarea; de asemenea, acesta a fost organist, sacristan și clopotar. Un al doilea post de profesor a fost creat în 1845. O nouă școală a fost construită pe Mönchacker în 1938. Vechea școală a servit drept primărie până în 1966; clădirea a fost demolată în 1967. În 1750, Breckenheim a obținut o alimentare mai bună cu apă prin forarea a nouă puțuri. Breckenheim avea o populație evreiască relativ mare: în 1794, aceasta era de aproximativ 5%. În 1831, ducele Wilhelm zu Nassau a emis o scrisoare de protecție pentru evreul Salomon din Breckenheim. În 1843, 32 din 707 locuitori erau evrei. În 1859, locuitorii evrei din Langenhain, Medenbach și Wildsachsen făceau parte și din comunitatea evreiască din Breckenheim. Familia Adolf și Rosa Kahn a condus o afacere cu fructe și hrană pentru animale în sat în jurul anului 1900; Adolf Kahn a fost unul dintre fondatorii societății corale "Eintracht", care a fost înființată în 1885. Breckenheim a devenit parte din Nassau odată cu deputația imperială din 1803 și apoi din Prusia în 1866.

Începând cu anii 1830, drumurile locale și autostrada spre Igstadt au fost extinse. După numeroase petiții, în 1804 a fost construit un nou vicariat, iar în 1845 a fost creat un al doilea post didactic. În sat exista o brigadă de pompieri încă din 1763. Breckenheim a fost conectat la rețeaua electrică în 1911. În 1928/29, satul a primit o alimentare modernă cu apă. Din 1927, a existat un serviciu municipal de autobuz de la Breckenheim la Bierstadt; de acolo, era posibil să se ia tramvaiul electric până la Wiesbaden.

Breckenheim a rămas un sat agricol până în anii 1950, dar agricultura nu mai era principala sursă de venit pentru locuitori. Din ce în ce mai mulți locuitori din Breckenheim s-au orientat spre croitorie și, mai ales, spre construcții. Livrările de lapte către orașul balnear din apropiere au reprezentat o sursă suplimentară de venit. Primele cluburi au fost înființate în sat începând din anii 1880: societatea corală "Eintracht" în 1885, clubul de gimnastică Breckenheim în 1890, clubul de creștere a păsărilor în 1907, clubul pompierilor în 1910, clubul de ciclism Solidarität în 1912 și societatea corală "Frohsinn" în 1922. În Primul Război Mondial au existat 24 de victime, pentru care a fost ridicat un memorial în fața bisericii în 1923, după retragerea ocupației franceze. Comunitatea a supraviețuit celui de-al Doilea Război Mondial în mare parte nevătămată, cu excepția a 64 de morți și dispăruți.

După cel de-al Doilea Război Mondial, populația a crescut considerabil datorită afluxului de persoane strămutate (1939: 826 locuitori; 1946: 1065 locuitori; 1950: 1142 locuitori). În anii 1960, Breckenheim a devenit o comunitate rezidențială favorizată. Zone mari de construcție au fost desemnate pentru persoanele din Wiesbaden, Mainz și Frankfurt care doreau să construiască, inițial "Auf der Ahl" și în zona "Die Weinberge", ulterior fiind adăugate "Prügelwiese" și "Prügelgärten". În 1965 a fost construită o clădire multifuncțională pentru a găzdui primăria, stația de pompieri și șapte apartamente. Până în 1980, populația s-a triplat. În 2014, Breckenheim avea aproximativ 3 300 de locuitori.

În anii 1960, satul a primit o stemă bazată pe vechiul sigiliu al curții, care înfățișează o sabie verticală de argint cu mâner de aur și solzi de aur în roșu. În 1974, autoritățile municipale au decis ca Breckenheim să fie încorporat în Wiesbaden. La 21 iunie 1974, parlamentul landului Hessian a aprobat această cerere, iar încorporarea a avut loc la 1 ianuarie 1977.