Breckenheim a accueilli un site de peuplement chalamanique précoce de la fin du 3e siècle jusqu'au début du 5e siècle après J.-C.. Si l'on se base sur le nom du lieu, il est probable, comme pour Delkenheim, qu'il s'agisse d'une fondation franque datant du 6ème au 9ème siècle. Breckenheim est mentionné pour la première fois le 01.05.950 dans un diplôme du roi Otto Ier ; depuis 1137, Breckenheim appartenait aux seigneurs d'Eppstein. Breckenheim était l'un des villages les plus riches de leur seigneurie, ils y possédaient une ferme fortifiée, dont faisait probablement partie un moulin mentionné en 1300. Le chapitre de la cathédrale de Mayence, le couvent Mariengredenstift et le monastère de Bleidenstadt étaient d'importants propriétaires fonciers ecclésiastiques.

Comme d'autres localités du Ländchen, B. s'est retrouvé au début du 15ème siècle au cœur des conflits entre les comtes de Nassau et les seigneurs d'Eppstein ; fin 1417, la localité a été incendiée lors d'une vendetta. En 1480/88, les Eppstein ont donné Breckenheim en gage aux comtes palatins du Rhin. En 1492, Breckenheim et le reste du "Ländchen" ont finalement été cédés au landgraviat de Hesse.

Une chapelle à Breckenheim est mentionnée pour la première fois le 15.05.1251 ; elle était dédiée à Saint-Nicolas et devint une église paroissiale indépendante en 1310. En 1655, Medenbach et la commune de Wildsachsen qui lui est rattachée étaient une filiale de Breckenheim. La séparation n'a eu lieu qu'en 1984. La Réforme a été introduite en 1530. Lors d'un incendie qui détruisit la plus grande partie de la localité, l'église fut détruite en 1638 ; seul le clocher roman survécut. De 1720 à 1724, une nouvelle église baroque a été construite et la tour a été rénovée. L'église était le centre de la localité. C'est devant elle que se réunissait le tribunal, mentionné pour la première fois en 1300. Il était présidé par le "Schultheiß", nommé par les habitants d'Eppstein ; il exerçait le pouvoir de commandement et le droit pénal dans le village. Il était assisté de 16 dingmans en 1368 et de cinq échevins en 1375. Le tribunal de Mechtildshausen était compétent pour la justice du sang. Un sceau du tribunal datant de 1729 montre Saint Michel avec une épée dans la main droite et une balance dans la main gauche.

À la fin du Moyen Âge, Breckenheim était une importante commune viticole ; le village fournissait le vin de messe au couvent de Bleidenstadt. Après la guerre de Trente Ans, la culture de la vigne a toutefois diminué ; on a cherché à améliorer les conditions économiques pesantes par la culture du tabac et des fruits, par la fabrication de vinaigre de fruits, par l'élevage de moutons et le commerce de la laine. En 1570, une bergerie est mentionnée pour la première fois. En 1614, il y avait une bergerie et un moulin que le landgrave Moritz avait prêté à un administrateur de la poste de Francfort. En 1745, un moulin à huile, le "Klingenmühle", a été construit et a fonctionné jusqu'en 1900. Le "Lochmühle", un moulin à céréales, a existé de 1846 à 94.

En 1592, Breckenheim comptait 43 maisons et 160 habitants. La guerre de Trente Ans et la peste firent de nombreuses victimes, la commune ne comptait que huit habitants en 1638. Le village fut gravement dévasté. Les villages indépendants de Harpach et Costloff, qui comptaient alors 10 familles entre Breckenheim et Medenbach, furent également rasés et ne furent jamais reconstruits. Jusqu'en 1668, 30 familles résidaient à nouveau à Breckenheim.

En 1665, nous entendons parler pour la première fois des conditions scolaires. Cette année-là, le curé demanda des fonds pour rémunérer un maître d'école. Vers 1690, la première salle de classe est aménagée dans une grange dîmière. Jusqu'alors, les enfants devaient aller à l'école à Wallau. En 1724, la première "vraie" école avec deux salles de classe et un logement pour l'instituteur fut construite dans un bâtiment plus grand ; le maire avait en outre ses bureaux dans cette maison. Avec l'introduction de l'école obligatoire en 1755, un instituteur qualifié se chargea pour la première fois de l'enseignement ; il faisait également office d'organiste, de sacristain et de sonneur de cloche. En 1845, un deuxième poste d'enseignant a été créé. En 1938, une nouvelle école a été construite sur le Mönchacker. L'ancienne école a servi de mairie jusqu'en 1966 ; le bâtiment a été démoli en 1967. En 1750, Breckenheim obtint un meilleur approvisionnement en eau grâce au forage de neuf puits. Breckenheim avait une population juive relativement importante : en 1794, elle représentait environ 5 % de la population. En 1831, le duc Wilhelm zu Nassau a délivré une lettre de protection au juif Salomon de Breckenheim. En 1843, 32 des 707 habitants étaient juifs. En 1859, les habitants juifs de Langenhain, Medenbach et Wildsachsen faisaient également partie de la communauté juive de Breckenheim. Vers 1900, la famille Adolf et Rosa Kahn exploitait un magasin de fruits et de fourrage dans le village ; Adolf Kahn faisait partie des fondateurs de l'association de chant "Eintracht", fondée en 1885. Avec la décision principale de la députation impériale de 1803, Breckenheim devint une ville de Nassau, puis prussienne en 1866.

Depuis les années 1830, les routes locales et la chaussée menant à Igstadt ont été aménagées. Après de nombreuses demandes, un nouveau presbytère fut construit en 1804 et un deuxième poste d'enseignant fut créé en 1845. Depuis 1763, le village disposait d'un corps de pompiers. En 1911, Breckenheim fut raccordé au réseau électrique. En 1928/29, le village fut doté d'un système moderne d'approvisionnement en eau. Depuis 1927, il existait une ligne d'omnibus municipale reliant Breckenheim à Bierstadt ; de là, on pouvait prendre le tramway électrique pour se rendre à Wiesbaden.

Breckenheim est resté un village agricole jusque dans les années 1950, mais l'agriculture ne constituait plus depuis longtemps la principale activité des habitants. De plus en plus d'habitants de Breckenheim se tournaient vers la couture et surtout vers le bâtiment. Les livraisons de lait à la ville thermale toute proche constituaient une source de revenus supplémentaire. Les premières associations se sont créées dans le village à partir des années 1880 : en 1885, l'association de chant "Eintracht", en 1890, l'association de gymnastique de Breckenheim, en 1907, l'association d'aviculture, en 1910, l'association des pompiers, en 1912, l'association cycliste Solidarität, en 1922, l'association de chant "Frohsinn". Pendant la Première Guerre mondiale, on déplora 24 morts, pour lesquels un monument d'honneur fut érigé devant l'église en 1923, après le départ de l'occupant français. La commune a traversé la Seconde Guerre mondiale sans trop de dommages, si l'on fait abstraction de 64 morts et disparus.

Après la Seconde Guerre mondiale, la population a fortement augmenté grâce à l'arrivée de personnes déplacées (1939 : 826 habitants ; 1946 : 1065 habitants ; 1950 : 1142 habitants). Dans les années 1960, Breckenheim est devenue une commune résidentielle de choix. De grands terrains à bâtir ont été aménagés pour les candidats à la construction de Wiesbaden, Mayence et Francfort, tout d'abord "Auf der Ahl" et dans la zone "Die Weinberge", auxquels se sont ajoutés plus tard "Prügelwiese" et "Prügelgärten". Un bâtiment polyvalent destiné à abriter la mairie, la caserne des pompiers, ainsi que sept appartements, a été construit en 1965. Jusqu'en 1980, le nombre d'habitants a triplé. En 2014, Breckenheim comptait environ 3.300 habitants.

Dans les années 1960, le village s'est doté d'armoiries qui reprennent l'ancien sceau du tribunal et représentent en rouge une épée d'argent posée verticalement avec une poignée d'or et une balance d'or. En 1974, les autorités communales décidèrent que Breckenheim devait être rattaché à Wiesbaden. Le 21 juin 1974, le Landtag de Hesse a accepté cette demande et l'incorporation a eu lieu le 1er janvier 1977.