Narodziny zawodu farmaceuty w późniejszych Niemczech nastąpiły w 1241 roku, kiedy cesarz Fryderyk II wydał rozporządzenie medyczne, które prawnie nakazało rozdzielenie zawodów lekarza i farmaceuty. Jednak w tym czasie w Wiesbaden prawdopodobnie nie było apteki. Początki zaopatrywania mieszkańców Wiesbaden w leki owiane są tajemnicą. Przez długi czas, podobnie jak w większości społeczności, prawdopodobnie dostarczały je głównie kobiety, które znały się na leczeniu i ziołach.

Wojna trzydziestoletnia pozostawiła w Wiesbaden poważne zniszczenia: w 1646 r. w murach zniszczonego miasta żyło tylko 51 obywateli. Niedługo później, w grudniu 1650 roku, hrabia Johann udzielił Otto Wilhelmowi Dorschowi pozwolenia na założenie apteki, która od 1654 roku mieściła się w gospodzie "Zum Einhorn", której nazwę również nosiła. Istniała ona jednak tylko przez niecałe dziesięć lat, więc za pierwszą stałą aptekę w Wiesbaden należy uznać inną aptekę: Późniejsza "Hofapotheke" została założona w 1672 roku przez Johanna Graßera, mieszkańca Frankfurtu. W 1808 r. stała się własnością Johanna Augusta Lade, który kupił ją od Johanna Eberleina. W styczniu 1811 r. Lade, podobnie jak wcześniej Eberlein, otrzymał tytuł "nadwornego aptekarza".

Dopiero w 1813 r. kandydat na aptekarza, dr Karl Philipp Otto, otrzymał licencję na założenie drugiej apteki w Wiesbaden, "Zum goldenen Löwen". Została ona założona w dawnej gospodzie "Zum goldenen Wolf" naprzeciwko Adlera. Otto był również badaczem i filozofem. Mówi się, że Goethe z zainteresowaniem czytał jego prace podczas pobytu w uzdrowisku. Jednak Otto najwyraźniej poświęcał zbyt mało czasu swojemu biznesowi, ponieważ musiał opuścić Wiesbaden w 1814 roku z powodu wysokich długów. Jego apteka została wystawiona na aukcji i trafiła do frankfurckiego sklepu z farbami. Caspar Adam Müller wydzierżawił ją od tego ostatniego, a następnie kupił za 24 500 guldenów, ponownie otwierając ją jako "Löwen-Apotheke" 1 maja 1815 roku.

Przepisy medyczne Księstwa Nassau z 1818 r. dokładnie regulowały warunki pracy farmaceutów: byli oni uważani za urzędników państwowych, ale musieli pobierać pensję wyłącznie z dochodów swojej firmy zgodnie z tabelą opłat, która została ustalona po raz pierwszy (i wielokrotnie ponownie regulowana). W rzeczywistości w każdym okręgu medycznym księstwa miała być tylko jedna apteka. Ponieważ w Wiesbaden istniały już dwie, "Hofapotheke", która później została przemianowana na "Schützenapotheke", została bezceremonialnie oficjalną apteką okręgu medycznego "Wiesbaden-Stadt", podczas gdy "Löwen-Apotheke" została oficjalną apteką okręgu medycznego "Wiesbaden-Land".

Szybko rosnąca populacja i coraz większy ruch uzdrowiskowy w Wiesbaden sprawiły, że konieczne stało się założenie kolejnych aptek. Nie miały one jednak oficjalnego charakteru, a istniały jedynie na podstawie licencji. Początkowo była to "Hirschapotheke" z 1837 roku, której właściciel Herber wynajął Kalbsche Haus am Markt przy Marktstraße na swoją siedzibę od 1839 roku. Od 1841 r. prowadzono również negocjacje w sprawie utworzenia czwartej apteki, ale zostały one sfinalizowane dopiero w 1863 r., po tym jak wnioskodawca Adolph Seyberth przekazał szpitalowi darowiznę w wysokości 10 000 guldenów. Otrzymał on pozwolenie na założenie apteki "Adlerapotheke" przy Kirchgasse. Powodem, dla którego otwieranie nowych aptek było tak ściśle regulowane, były kwestie finansowe: w wyraźnym interesie rządu było, aby farmaceuci zbili dużą fortunę, ponieważ zakładano, że zawsze będą mieli wystarczającą podaż materiałów, tj. surowców do produkcji leków, oraz zdolnych asystentów. Aby zapewnić im nie tylko dobrą pozycję finansową, ale także zachęcić do profesjonalizacji, od 1844 r. trucizny i silnie działające substancje mogły być sprzedawane wyłącznie przez farmaceutów, ale już nie przez kupców materiałowych lub chemików.

Aneksja Nassau przez Prusy w 1866 r. ponownie przyniosła pewne innowacje dla Wiesbaden: przywileje aptek nadal istniały, ale ich właściciele nie byli już zatrudniani przez państwo.

W marcu 1867 r. w Wiesbaden wprowadzono znormalizowaną pruską wagę medyczną, a aptekarze musieli sami ponieść znaczne koszty nowych odważników. Od 1868 r. w Wiesbaden obowiązywała również "Altländische Visitationsverfahren" ("procedura wizytacji w starym stylu"), co oznaczało, że apteki musiały być dokładnie kontrolowane przez komisję co trzy lata. W Księstwie Nassau takie inspekcje nie odbywały się regularnie, a jedynie w następstwie skarg. Wraz z szybko rosnącą populacją Wiesbaden powstały kolejne nowe apteki: Taunusapotheke w 1870 r., Viktoria-Apotheke w 1878 r. i Wilhelms-Apotheke w 1888 r., dla której znany farmaceuta wojskowy Wilhelm Lenz złożył wniosek o licencję na prowadzenie działalności. Theresienapotheke, otwarta w 1893 r. przy Emserstrasse i Wellritzstrasse, oraz Oranienapotheke, otwarta w 1894 r., świadczą o znaczeniu zaopatrywania ludności w leki w nowych obszarach rozwoju miasta. Po 1900 roku nowe apteki powstawały niemal wyłącznie na obrzeżach miasta lub w miastach przyłączonych.

Wraz z postępującą industrializacją zmienił się również zakres odpowiedzialności farmaceutów: mieli oni mniej do przygotowania, ale coraz ważniejsze stawało się testowanie jakości i tożsamości, a także sprzedaż ręczna. To właśnie przemysłowa produkcja produktów farmaceutycznych sprawiła, że stały się one tak tanie dla wielu osób, że mogły sobie teraz na nie pozwolić. Wzrosła również klientela farmaceutów z Wiesbaden.

Po pierwszej wojnie światowej Wiesbaden znajdowało się początkowo pod okupacją francuską, a od 1925 roku pod okupacją brytyjską. Około 1920 roku w mieście działało dziesięć aptek, z których dwie wyraźnie nazywały się "Pharmacie internationale" i "Pharmacie anglo-francaise". Kiedy siły okupacyjne wycofały się w 1930 r., podjęto próby jak najszybszego ożywienia lecznictwa, które od lat znajdowało się w stagnacji. Bogaty farmaceuta z Wiesbaden Adam Herbert oraz Hugo Reisinger, który wyemigrował do Ameryki, podarowali kompleks Reisinger and Herbert naprzeciwko głównego dworca kolejowego, który do dziś jest jedną z wizytówek miasta.

W kolejnych latach liczba aptek również rosła w bezprecedensowym tempie: rzut oka na książkę adresową Wiesbaden z 1938 roku ujawnia, że istniały już 22 sklepy farmaceutyczne, z których żaden nie był oznaczony jako "międzynarodowy". Zamiast tego reklamowały one badania moczu i leki homeopatyczne.

W okresie po II wojnie światowej apteki w Wiesbaden musiały zmagać się nie tylko z kiepską sytuacją zaopatrzeniową, która dotyczyła również leków. Niektóre placówki, takie jak apteka Adler, zostały tak poważnie uszkodzone przez bomby, że rodzina Seyberth, która była jej właścicielem, musiała przenieść się do nowego budynku na rogu Kirchgasse i Friedrichstraße. Niektórzy właściciele, tacy jak rodzina Mück, musieli opuścić swoją aptekę na rozkaz sił okupacyjnych, ponieważ lokal biznesowy przy Luisenstraße był "niedostępny". Apteka Wilhelms musiała zostać przeniesiona na Wilhelmstraße. Jednak liczba aptek stale rosła - w 1951 r. w Wiesbaden było ich 37 - a kosmopolityczna atmosfera miasta uzdrowiskowego powróciła: Löwen-Apotheke ponownie nazywała się "Pharmacie internationale".

Od 1958 roku w Niemczech panowała swoboda przedsiębiorczości, co oznaczało, że każdy farmaceuta mógł otworzyć sklep w dowolnym miejscu - niezależnie od popytu. To nowe rozporządzenie miało również poważne konsekwencje dla Wiesbaden: Wraz ze wzrostem populacji Wiesbaden i rozwojem nowych obszarów mieszkalnych, wzrosła liczba aptek w mieście uzdrowiskowym: w 1969 r. było ich 61, w 1976 r. 75, a w 1989 r. aż 85. Tylko w latach 2005-2008 w Wiesbaden otwarto siedem nowych aptek.

Obecnie (stan na 2013 r.) około 125 aptek w Wiesbaden to przede wszystkim centrum informacji i porad. Wybór właściwej lokalizacji jest kluczowy, podobnie jak na początku XVII wieku. Podczas gdy w tamtych czasach znajdowały się one głównie przy głównych ulicach, obecnie wiele aptek wybrało lokalizację w pobliżu centrum medycznego, aby jak najwięcej pacjentów mogło zrealizować tam swoje recepty. Od 1 stycznia 2004 r. farmaceuci mogą prowadzić maksymalnie trzy dodatkowe tzw. apteki oddziałowe.