Зародження професії фармацевта в пізнішій Німеччині припадає на 1241 рік, коли імператор Фрідріх II видав медичний ордонанс, який юридично розмежував професії лікаря і фармацевта. Однак у цей час у Вісбадені, ймовірно, не було жодної аптеки. Початок постачання ліків мешканцям Вісбадена оповитий таємницею. Тривалий час, як і в більшості громад, його, ймовірно, забезпечували переважно жінки, які зналися на лікуванні та травах.

Тридцятилітня війна залишила у Вісбадені сильне спустошення: у 1646 році в стінах зруйнованого міста проживав лише 51 мешканець. Невдовзі, у грудні 1650 року, граф Йоганн надав Отто Вільгельму Доршу дозвіл на відкриття аптеки, яка з 1654 року розташовувалася в корчмі "Zum Einhorn", чию назву вона також носила. Однак вона проіснувала лише трохи менше десяти років, тож першою постійною аптекою у Вісбадені слід вважати іншу аптеку: Пізніша "Гофапотека" була заснована у 1672 році франкфуртцем Йоганном Ґрасером (Johann Graßer). У 1808 році вона перейшла у власність Йоганна Августа Ладе, який купив її у Йоганна Еберлейна. У січні 1811 року Ладе, як і Еберлейн до нього, отримав звання "придворного фармацевта".

Лише у 1813 році кандидат фармацевтичних наук доктор Карл Філіп Отто отримав ліцензію на відкриття другої вісбаденської аптеки "Zum golden Löwen" ("Золотий льон"). Її було відкрито в колишньому трактирі "Zum golden Wolf" навпроти Адлера. Отто був також дослідником і філософом. Кажуть, що Гете з цікавістю читав його твори під час перебування на курорті. Однак Отто, очевидно, приділяв занадто мало часу своїй справі, оскільки в 1814 році йому довелося покинути Вісбаден через великі борги. Його аптека була виставлена на аукціон і перейшла до франкфуртської малярної майстерні. Каспар Адам Мюллер орендував її в останньої, а згодом викупив за 24 500 гульденів і 1 травня 1815 року знову відкрив під назвою "Löwen-Apotheke".

Медичний регламент герцогства Нассау від 1818 року чітко регламентував умови праці аптекарів: вони вважалися державними службовцями, але мали отримувати заробітну плату виключно з доходів від своєї діяльності відповідно до тарифної сітки, яка була вперше визначена (і неодноразово переглядалася). У кожному медичному окрузі герцогства фактично мала бути лише одна аптека. Оскільки у Вісбадені їх уже було дві, "Гофапотека", яку згодом перейменували на "Шютценапотека", безцеремонно стала офіційною аптекою медичного округу "Вісбаден-штадт", а "Льовен-аптека" - офіційною аптекою медичного округу "Вісбаден-ланд".

Швидке зростання населення та постійно зростаючий курортний трафік Вісбадена зумовили необхідність заснування нових аптек. Однак вони не мали офіційного характеру, а існували лише за ліцензією. Спочатку це була "Hirschapotheke" з 1837 року, власник якої Гербер з 1839 року орендував для свого бізнесу приміщення в будинку Kalbsche Haus am Markt на вулиці Марктштрассе. З 1841 року велися також переговори про створення четвертої аптеки, але вони не були завершені до 1863 року, після того, як заявник Адольф Сейберт зробив пожертву в розмірі 10 000 гульденів на користь лікарні. Тепер йому було дозволено відкрити аптеку "Adlerapotheke" на Кірхгассе. Причина, чому відкриття нових аптек так суворо регламентувалося, була фінансовою: уряд був явно зацікавлений у тому, щоб аптекарі заробили великі статки, оскільки передбачалося, що тоді вони завжди матимуть достатній запас матеріалів, тобто сировини для виробництва ліків, і здібних помічників. Щоб забезпечити їм не лише хороше фінансове становище, але й заохотити їхню професіоналізацію, з 1844 року отрути та сильнодіючі речовини могли продавати лише аптекарі, а не торговці матеріалами чи хіміки.

Анексія Нассау Пруссією у 1866 році знову принесла Вісбадену деякі нововведення: привілеї аптек продовжували існувати, але їхні власники більше не працювали на державу.

У березні 1867 року у Вісбадені було запроваджено стандартизовану прусську медичну вагу, і аптекарям довелося самостійно нести значні витрати на нові ваги. З 1868 року у Вісбадені також почали застосовувати "Altländische Visitationsverfahren" ("порядок відвідування за старим стилем"), що означало, що аптеки повинні були ретельно перевірятися комісією кожні три роки. У герцогстві Нассау такі перевірки відбувалися нерегулярно, а лише після надходження скарг. Зі стрімким зростанням населення Вісбадена були засновані нові аптеки: Таунусапотека у 1870 році, Вікторія-аптека у 1878 році та Вільгельм-аптека у 1888 році, для якої відомий військовий фармацевт Вільгельм Ленц подав заяву на отримання ліцензії на діяльність. Відкриті у 1893 році на вулицях Емзерштрассе та Вельріцштрассе "Терезіанапотека" та "Ораніанапотека", відкрита у 1894 році, свідчать про важливість забезпечення населення медикаментами у нових районах забудови міста. Після 1900 року нові аптеки відкривалися майже виключно на околицях міста або в містах, що входили до складу міста.

Зі зростанням індустріалізації змінилася і сфера відповідальності фармацевтів: вони мали менше часу на самопідготовку, натомість дедалі більшого значення набувала перевірка якості та ідентичності, а також ручний продаж. Саме промислове виробництво фармацевтичної продукції зробило її настільки дешевою для багатьох, що тепер вони могли собі її дозволити. Клієнтура вісбаденських аптекарів також зростала.

Після Першої світової війни Вісбаден спочатку перебував під французькою окупацією, а з 1925 року - під британською. Близько 1920 року в місті було десять аптек, дві з яких тепер відкрито називали себе "Pharmacie internationale" та "Pharmacie anglo-francaise". Після відходу окупаційних військ у 1930 році було зроблено спробу якнайшвидше відновити лікування, яке роками перебувало у стані стагнації. Заможні вісбаденські фармацевти Адам Герберт і Гуго Райзінгер, які емігрували до Америки, подарували комплекс "Райзінгер і Герберт" навпроти головного залізничного вокзалу, який і сьогодні є однією з візитівок міста.

У наступні роки кількість аптек також зростала безпрецедентними темпами: зазирнувши до вісбаденської адресної книги 1938 року, можна побачити, що у Вісбадені налічувалося 22 аптеки, жодна з яких не була позначена як "міжнародна". Натомість вони рекламували аналізи сечі та гомеопатичні засоби.

У період після Другої світової війни аптекам Вісбадена доводилося боротися не лише з поганим постачанням, що позначилося і на ліках. Деякі заклади, як, наприклад, аптека Адлера, були настільки сильно пошкоджені бомбами, що сім'я Сейбертів, яка володіла нею, змушена була переїхати в нову будівлю на розі вулиць Кірхгассе та Фрідріхштрассе. Деякі власники, такі як сім'я Мюк, були змушені звільнити свою аптеку за наказом окупаційної влади, оскільки приміщення на вулиці Луїзенштрассе були "закритими". Аптеку Вільгельмів довелося перенести на Вільгельмштрассе. Однак кількість аптек постійно зростала, і в 1951 році у Вісбадені їх було 37 - і космополітичний дух курортного міста повернувся: Löwen-Apotheke знову стала називатися "Pharmacie internationale".

З 1958 року в Німеччині панує свобода відкриття аптек, що означає, що будь-який фармацевт може відкрити аптеку в будь-якому місці - незалежно від попиту. Це нове регулювання також мало серйозні наслідки для Вісбадена: Зі зростанням населення Вісбадена та розбудовою нових житлових районів зростала і кількість аптек у місті-курорті: у 1969 році їх була 61, у 1976 році - 75, а у 1989 році - аж 85. Лише з 2005 по 2008 рік у Вісбадені було відкрито сім нових аптек.

Сьогодні (станом на 2013 рік) приблизно 125 аптек у Вісбадені є насамперед центром інформації та консультацій. Вибір правильного місця розташування має вирішальне значення, як і на початку 17 століття. Якщо тоді аптеки розташовувалися переважно на головних вулицях, то сьогодні багато аптек обирають місце біля медичного центру, щоб якомога більше пацієнтів могли отримати там ліки за своїми рецептами. З 1 січня 2004 року фармацевтам дозволено мати до трьох додаткових так званих "філіалів".