La nascita della professione di farmacista nella Germania successiva risale al 1241, quando l'imperatore Federico II emanò un'ordinanza medica che prescriveva legalmente la separazione delle professioni di medico e farmacista. A quell'epoca, tuttavia, probabilmente non esisteva alcuna farmacia a Wiesbaden. Gli inizi della fornitura di medicinali ai cittadini di Wiesbaden sono avvolti nel mistero. Per molto tempo, come nella maggior parte delle comunità, probabilmente le medicine erano fornite principalmente da donne esperte di cure e di erbe.

La Guerra dei Trent'anni lasciò a Wiesbaden gravi devastazioni: si dice che nel 1646 solo 51 cittadini vivessero all'interno delle mura della città distrutta. Poco tempo dopo, nel dicembre 1650, il conte Johann concesse a Otto Wilhelm Dorsch il permesso di aprire una farmacia, che dal 1654 si trovava nella locanda "Zum Einhorn", di cui portava anche il nome. Tuttavia, essa esistette solo per poco meno di dieci anni, per cui un'altra farmacia deve essere considerata la prima farmacia permanente di Wiesbaden: La successiva "Hofapotheke" fu fondata nel 1672 da Johann Graßer, cittadino di Francoforte. Nel 1808 divenne proprietà di Johann August Lade, che la acquistò da Johann Eberlein. Nel gennaio 1811, Lade, come Eberlein prima di lui, ottenne il titolo di "Farmacista di Corte".

Solo nel 1813 il candidato alla cattedra di farmacia, il dottor Karl Philipp Otto, ottenne la licenza per aprire una seconda farmacia a Wiesbaden, la "Zum goldenen Löwen". La farmacia fu allestita nell'ex locanda "Zum goldenen Wolf", di fronte all'Adler. Otto fu anche ricercatore e filosofo. Si dice che Goethe abbia letto con interesse le sue opere durante un soggiorno alle terme. Tuttavia, Otto dedicò evidentemente troppo poco tempo alla sua attività, visto che nel 1814 dovette fuggire da Wiesbaden a causa dei forti debiti. La sua farmacia fu messa all'asta e andò al negozio di vernici di Francoforte. Caspar Adam Müller la prese in affitto da quest'ultimo e successivamente la acquistò per 24.500 fiorini, riaprendola come "Löwen-Apotheke" il 1° maggio 1815.

Il regolamento medico del Ducato di Nassau del 1818 regolamentava con precisione le condizioni dei farmacisti: essi erano considerati dipendenti pubblici, ma dovevano trarre il loro stipendio esclusivamente dalle entrate della loro attività, in conformità con la tabella degli onorari, che veniva ora determinata per la prima volta (e ripetutamente riregolata). In realtà doveva esserci una sola farmacia in ogni distretto medico del ducato. Poiché a Wiesbaden ce n'erano già due, la "Hofapotheke", in seguito ribattezzata "Schützenapotheke", fu resa senza tanti complimenti la farmacia ufficiale del distretto medico "Wiesbaden-Stadt", mentre la "Löwen-Apotheke" fu resa la farmacia ufficiale del distretto medico "Wiesbaden-Land".

La rapida crescita della popolazione e il sempre maggiore traffico termale di Wiesbaden resero necessaria la creazione di altre farmacie. Tuttavia, queste non avevano carattere ufficiale, ma esistevano solo su licenza. Inizialmente si trattava della "Hirschapotheke" dal 1837, il cui proprietario Herber affittò la Kalbsche Haus am Markt in Marktstraße per i suoi locali commerciali dal 1839. A partire dal 1841 si svolsero anche trattative per l'istituzione di una quarta farmacia, che però si conclusero solo nel 1863, dopo che il richiedente Adolph Seyberth aveva fatto una donazione di 10.000 fiorini all'ospedale. A questo punto gli fu permesso di aprire la farmacia "Adlerapotheke" nella Kirchgasse. Il motivo per cui l'apertura di nuove farmacie era così rigidamente regolamentata era di natura finanziaria: era esplicitamente nell'interesse del governo che i farmacisti facessero una grande fortuna, poiché si presumeva che avrebbero sempre avuto una sufficiente disponibilità di materiali, cioè di materie prime per la produzione di farmaci, e di assistenti capaci. Per garantire una buona posizione finanziaria, ma anche per incoraggiare la loro professionalizzazione, dal 1844 i veleni e le sostanze ad azione forte potevano essere venduti solo dai farmacisti, ma non più dai commercianti di materiali o dai farmacisti.

L'annessione di Nassau alla Prussia, nel 1866, portò di nuovo alcune innovazioni per Wiesbaden: i privilegi delle farmacie continuarono ad esistere, ma i loro proprietari non erano più dipendenti dello Stato.

Nel marzo 1867 fu introdotto a Wiesbaden il peso medico prussiano standardizzato, e i farmacisti dovettero sostenere da soli i notevoli costi dei nuovi pesi. A partire dal 1868, anche a Wiesbaden venne applicata la "Altländische Visitationsverfahren" ("procedura di visita vecchio stile"), il che significava che le farmacie dovevano essere attentamente ispezionate da una commissione ogni tre anni. Nel Ducato di Nassau, tali visite non avevano luogo regolarmente, ma solo in seguito a reclami. Con la rapida crescita della popolazione di Wiesbaden, furono fondate altre nuove farmacie: Si tratta della Taunusapotheke nel 1870, della Viktoria-Apotheke nel 1878 e della Wilhelms-Apotheke nel 1888, per la quale il noto farmacista militare Wilhelm Lenz aveva richiesto la licenza di esercizio. La Theresienapotheke, aperta nel 1893 in Emserstrasse e Wellritzstrasse, e la Oranienapotheke, aperta nel 1894, testimoniano l'importanza di rifornire la popolazione di medicinali nelle nuove aree di sviluppo della città. Dopo il 1900, le nuove farmacie furono fondate quasi esclusivamente nella periferia della città o nelle città incorporate.

Con l'aumento dell'industrializzazione, anche l'area di responsabilità dei farmacisti cambiò: avevano meno da preparare, ma i test di qualità e di identità e la vendita manuale divennero sempre più importanti. Fu la produzione industriale di prodotti farmaceutici a renderli così economici per molti da poterseli permettere. Anche la clientela dei farmacisti di Wiesbaden crebbe.

Dopo la Prima Guerra Mondiale, Wiesbaden fu inizialmente sotto l'occupazione francese e dal 1925 sotto quella britannica. Intorno al 1920, la città contava dieci farmacie, due delle quali si chiamavano esplicitamente "Pharmacie internationale" e "Pharmacie anglo-francaise". Quando le forze di occupazione si ritirarono nel 1930, si cercò di rivitalizzare il più rapidamente possibile la cura, che era rimasta stagnante per anni. Il ricco farmacista di Wiesbaden Adam Herbert e Hugo Reisinger, emigrato in America, donarono il complesso Reisinger e Herbert di fronte alla stazione ferroviaria principale, che ancora oggi è uno dei biglietti da visita della città.

Negli anni successivi, anche il numero di farmacie aumentò a un ritmo senza precedenti: uno sguardo all'indirizzario di Wiesbaden del 1938 rivela che c'erano ormai 22 negozi di prodotti farmaceutici, nessuno dei quali era etichettato come "internazionale". Al contrario, pubblicizzavano urinarie e rimedi omeopatici.

Nel periodo successivo alla Seconda Guerra Mondiale, le farmacie di Wiesbaden non solo dovettero fare i conti con la situazione di scarso approvvigionamento, che riguardava anche i medicinali. Alcuni stabilimenti, come la Farmacia Adler, furono così gravemente danneggiati dalle bombe che la famiglia Seyberth, che ne era proprietaria, dovette trasferirsi in un nuovo edificio all'angolo tra Kirchgasse e Friedrichstraße. Alcuni proprietari, come la famiglia Mück, dovettero lasciare la loro farmacia su ordine delle forze di occupazione, poiché i locali commerciali in Luisenstraße erano "off limits". La farmacia Wilhelms dovette essere trasferita in Wilhelmstraße. Tuttavia, il numero di farmacie aumentò costantemente, con 37 a Wiesbaden nel 1951, e il fascino cosmopolita della città termale ritornò: la Löwen-Apotheke fu nuovamente chiamata "Pharmacie internationale".

Dal 1958 in Germania vige la libertà di stabilimento, il che significa che ogni farmacista può aprire un negozio in qualsiasi luogo, indipendentemente dalla domanda. Questa nuova normativa ebbe gravi conseguenze anche per Wiesbaden: Con l'aumento della popolazione di Wiesbaden e lo sviluppo di nuove aree residenziali, è aumentato anche il numero di farmacie nella città termale: nel 1969 ce n'erano 61, nel 1976 75 e nel 1989 ben 85. Solo tra il 2005 e il 2008 sono state aperte sette nuove farmacie a Wiesbaden.

Oggi (dal 2013), le circa 125 farmacie di Wiesbaden sono soprattutto un centro di informazione e consulenza. La scelta della giusta ubicazione è fondamentale, proprio come lo era agli albori, nel XVII secolo. Mentre allora si trovavano principalmente nelle strade principali, oggi molte farmacie hanno scelto una posizione vicina a un centro medico, in modo che il maggior numero possibile di pazienti possa compilare le proprie ricette. Dal 1° gennaio 2004, i farmacisti possono gestire fino a tre ulteriori "farmacie succursali".