Gli organi non si trovano solo nelle chiese cristiane, ma anche in ambienti profani, ad esempio nella Sala Thiersch del Kurhaus, nella sala del lutto del Cimitero Sud, nell'auditorium della Scuola Elly Heuss, nel Museo di Stato (Museum Wiesbaden) e in diverse case private. La storia organaria di Wiesbaden è ricca di strumenti storici perché i danni bellici sono stati relativamente pochi. Tuttavia, molti organi sono stati modificati nel corso del tempo per adattarli alle idee sonore e alle possibilità tecniche attuali. Nel frattempo, però, gli strumenti sono stati anche restaurati e riportati alle loro condizioni originali.

L'organo più grande e più antico del centro città si trova nella Marktkirche. Fu installato poco dopo la consacrazione della chiesa, nel 1863, dalla ditta Walcker di Ludwigsburg. L'imponente cassa, così come la maggior parte delle canne e i singoli mantici, sono stati conservati. L'organo è stato ricostruito, ampliato e modificato tecnicamente diverse volte; insieme all'organo corale installato nel 1982, attualmente conta 85 battute. L'azione è elettrica e dotata dei più moderni ausili per l'esecuzione, tra cui un sistema di auto-esecuzione. La ditta Walcker ha costruito altri quattro grandi strumenti, tre dei quali sono stati conservati:

L'organo della Lutherkirche (1911, III/50) è stato ampiamente restaurato e ricostruito nel 1987 e nel 2012, mentre gli organi della Ringkirche (1894, ora III/37) e della Oranier-Gedächtnis-Kirche di Biebrich (1905, III/42) sono stati pesantemente modificati. Tre grandi organi a Wiesbaden risalgono al dopoguerra: l'organo Steinmeyer nel Kurhaus (1954, III/48), l'organo Späth a St Elisabeth (1962, oggi IV/55) e l'organo Seifert a St Bonifatius (1954, oggi III/52). Gli ultimi due strumenti sono stati in seguito pesantemente modificati: nel 1985, San Bonifacio ha ricevuto una nuova cassa d'organo, nuove casse a vento con azione meccanica e molte nuove fermate (tra cui tre fermate elettroniche a pedale, installate in un secondo momento nel 1998); nel 1990, l'organo di Santa Elisabetta è stato spostato nella cantoria e dotato anch'esso di nuove casse, cassettoni e fermate.

La maggior parte degli organi di Wiesbaden è stata costruita tra il 1965 e il 1985, quando sono state costruite molte chiese e centri comunitari, soprattutto nei nuovi quartieri e nei sobborghi. Inoltre, esiste ancora un ricco patrimonio di strumenti antichi, per lo più di piccole dimensioni, che sono sopravvissuti ai secoli nelle vecchie chiese di paese, spesso con poche modifiche. Gli organi più antichi si trovano a Frauenstein, Naurod (1735) e Erbenheim (1790), sono tutti a un solo manuale (ma con pedale) e risalgono al XVIII secolo.

Due piccoli organi barocchi si trovano anche nel Landesmuseum (1750) e in una casa privata (1730). Strumenti della fine del XIX secolo sono conservati a Medenbach (1876), Breckenheim (1878), Sonnenberg (1883), Nordenstadt (1886), Auringen (1890), Dotzheim (1893), Delkenheim (1894) e Igstadt (1904). Tre di essi furono costruiti dall'organaro Christian Friedrich Voigt (o da suo figlio Heinrich) di Igstadt, che installò molti strumenti nella regione del Reno-Meno. I costruttori di organi Gebr. Mahr si erano precedentemente stabiliti a Wiesbaden, ma solo lo strumento di Erbenheim del 1790 è sopravvissuto qui. Dal 1986, a Wiesbaden sono stati installati nuovi organi utilizzando nuovamente i metodi di produzione storici (meccanica, azione sospesa, casse autoportanti in legno massiccio), con il coinvolgimento anche di aziende franco-alsaziane.

Nel complesso, ne risulta un quadro molto variopinto di organi di diverse dimensioni, periodi di costruzione, orientamento tonale, attrezzature tecniche e qualità. Il gran numero di strumenti storici della fine del XIX e dell'inizio del XX secolo è raramente presente in Germania.