Wiesbaden Müzesi'nin doğa tarihi koleksiyonları 1829 yılında "Verein für Naturkunde im Herzogthum Nassau" (daha sonra Nassauischer Verein für Naturkunde) tarafından bağımsız bir doğa tarihi müzesi olarak kurulmuştur ve en eski sivil doğa tarihi müzelerinden biridir. Erbprinzenpalais 'deki odalar 1915 yılına kadar kullanılmıştır. Daha sonra şimdi Friedrich-Ebert-Allee'de bulunan Landesmuseum'a taşınmıştır.

Johann Christian Gerning'in böcek koleksiyonu ilk yılların en önemli kazanımlarından biriydi. Goethe'nin girişimiyle(Goethe Wiesbaden'de) bu koleksiyon Gerning'in oğlu Johann Isaak von Gerning tarafından müzeye verilmiştir. Doğa bilimci ve sanatçı Maria Sibylla Merian'a ait koleksiyonları içermektedir. Başlangıçta bile bağışlar ve satın almalar Nassau sınırlarının ötesine geçmiştir. Örneğin Kont Brune de Mons (Havana) ve Ernst Albert Fritze (Jakarta), Wiesbaden'e Java kaplanları ve Sumatra gergedanları da dahil olmak üzere çok sayıda egzotik hayvan gönderdi. Özellikle Friedrich Albert Pompejus von Arnoldi, Anton Vigener ve Carl Ludwig Kirschbaum yerel koleksiyonları oluşturdular. Arnold Pagenstecher egzotik kelebeklerin ilk bilimsel tanımlarını yayınladı. Kendisi aynı zamanda uzun yıllar boyunca müzeye destek veren çok sayıda gönüllüden biriydi.

İlk eyalet jeoloğu Carl Koch, jeolojik-paleontolojik koleksiyonunu müzeye miras bırakmıştı. İlk jeolojik çalışmaları yürütmüş ve Nassau'nun haritasını çıkarmıştır. Onun çalışmaları sayesinde Wiesbaden güvenli bir su kaynağına kavuştu. Jeolog August Leppla da 1915'ten itibaren kendini müzenin jeolojik ve mineralojik koleksiyonlarına adadı. Paleontolojik koleksiyonlar halen ağırlıklı olarak Devoniyen, Tersiyer ve Pleistosen (Mosbach kumları), yani Mainz Havzası ve Taunus'tan buluntular içermektedir. Önemli paleontologlar arasında bölgenin jeolojik tarihini ilk kez özetleyen Guido Sandberger ve Fridolin von Sandberger kardeşler de yer almaktadır.

İlk sergiler sistematiğe odaklanmıştır. Ekoloji ve evrim 20. yüzyıla kadar ele alınmamıştır. Bir akvaryum sayesinde Wiesbaden halkı da müzeyle yoğun bir temas kurmuş ve özel sergiler düzenli programı tamamlamıştır. 21. yüzyılda sanata artan ilgi de göz önünde bulundurulmalıdır. Renk ve biçim gibi tematik kesişimler ele alınmıştır. Koleksiyonlar 2013 yılından bu yana yeni tasarlanan "Doğanın Estetiği" başlıklı sergide sunulmaktadır.

Bir milyondan fazla eserle müze artık sistematik, biyoçeşitlilik, ekoloji ve coğrafya gibi konularda önemli bir bilimsel bilgi deposuna sahiptir. Jeoloji, botanik ve zoolojinin yanı sıra etnolojik koleksiyonlar da temsi'in oğlu Johann Isaak von Gerning tarafından müzeye verilmiştir. Doğa bilimci ve sanatçı Maria Sibylla Merian'a ait koleksiyonları içermektedir. Başlangıçta bile bağışlar ve satın almalar Nassau sınırlarının ötesine geçmiştir. Örneğin Kont Brune de Mons (Havana) ve Ernst Albert Fritze (Jakarta), Wiesbaden'e Java kaplanları ve Sumatra gergedanları da dahil olmak üzere çok sayıda egzotik hayvan gönderdi. Özellikle Friedrich Albert Pompejus von Arnoldi, Anton Vigener ve Carl Ludwig Kirschbaum yerel koleksiyonları oluşturdular. Arnold Pagenstecher egzotik kelebeklerin ilk bilimsel tanımlarını yayınladı. Kendisi aynı zamanda uzun yıllar boyunca müzeye destek veren çok sayıda gönüllüden biriydi.

İlk eyalet jeoloğu Carl Koch, jeolojik-paleontolojik koleksiyonunu müzeye miras bırakmıştı. İlk jeolojik çalışmaları yürütmüş ve Nassau'nun haritasını çıkarmıştır. Onun çalışmaları sayesinde Wiesbaden güvenli bir su kaynağına kavuştu. Jeolog August Leppla da 1915'ten itibaren kendini müzenin jeolojik ve mineralojik koleksiyonlarına adadı. Paleontolojik koleksiyonlar halen ağırlıklı olarak Devoniyen, Tersiyer ve Pleistosen (Mosbach kumları), yani Mainz Havzası ve Taunus'tan buluntular içermektedir. Önemli paleontologlar arasında bölgenin jeolojik tarihini ilk kez özetleyen Guido Sandberger ve Fridolin von Sandberger kardeşler de yer almaktadır.

İlk sergiler sistematiğe odaklanmıştır. Ekoloji ve evrim 20. yüzyıla kadar ele alınmamıştır. Bir akvaryum sayesinde Wiesbaden halkı da müzeyle yoğun bir temas kurmuş ve özel sergiler düzenli programı tamamlamıştır. 21. yüzyılda sanata artan ilgi de göz önünde bulundurulmalıdır. Renk ve biçim gibi tematik kesişimler ele alınmıştır. Koleksiyonlar 2013 yılından bu yana yeni tasarlanan "Doğanın Estetiği" başlıklı sergide sunulmaktadır.

Bir milyondan fazla eserle müze artık sistematik, biyoçeşitlilik, ekoloji ve coğrafya gibi konularda önemli bir bilimsel bilgi deposuna sahiptir. Jeoloji, botanik ve zoolojinin yanı sıra etnolojik koleksiyonlar da temsil edilmektedir. Binlerce kitaptan oluşan ihtisas kütüphanesi bilim insanlarının ve halkın kullanımına açıktır. Bilgiyi aktarmak için yeni medya da kullanılmaktadır.