1. Ekosistemler dönüştürülmekte ve yok edilmektedir (örneğin daha yoğun arazi kullanımı ve artan kalkınma yoluyla)
2. İnsanlar ekosistemleri doğrudan sömürür (örneğin ormansızlaşma veya aşırı avlanma yoluyla)
3. Kirleticiler çevreyi kirletir (örneğin zehirli maddelerin boşaltılması veya aşırı gübreleme yoluyla)
4. İklim değişikliği (örneğin artan sıcaklıklar, kuraklık veya aşırı hava olayları nedeniyle)
5. İstilacı türler yerli hayvan ve bitki türlerinin yerini alır

İklim değişikliği biyoçeşitlilik kaybının ana nedeni olmasa da, önemi hızla artmaktadır. Özellikle halihazırda zarar görmüş ekosistemlerde daha az bireyin hayatta kalmasına, türlerin yerel olarak yok olmasına ve habitatların tahrip olmasına yol açmaktadır.

İklim değişikliği biyoçeşitliliği farklı şekillerde etkilemektedir. İşte birkaç örnek:

• Habitatlar ve dağılım alanları iklim değişikliklerine bağlı olarak değişmektedir. Örneğin Wiesbaden'de artık sıcak iklimi tercih eden muhabbet kuşları ve Asya kaplan sivrisineği ile karşılaşıyoruz. Öte yandan çim kurbağası, yavruları için ihtiyaç duyduğu sığ göletleri zorlukla bulabiliyor.
• Hayvanlar ve bitkiler davranışlarını değiştiriyor. Örneğin yerli kuşlarımızın çoğu, artık daha sıcak olan ilkbaharlarda çok daha erken ürüyor. Bu nedenle guguk kuşu kışlaklarından döndükten sonra yumurtalarını bırakacak daha az yuva buluyor.
• İklim değişikliği birçok türde birey sayısının azalmasına yol açıyor. Sonuç olarak, örneğin ateş semenderi giderek daha az üreme partneri bulmaktadır.

Değişen iklim koşullarından, örneğin menzillerini genişleterek fayda sağlayan hayvan ve bitki türleri de vardır. Ancak, potansiyel iklim kaybedenlerinin sayısı çok daha fazladır.