1. Екосистемите се трансформират и унищожават (например чрез по-интензивно използване на земята и нарастващо развитие).
2. Хората пряко експлоатират екосистемите (например чрез обезлесяване или свръхулов)
3. Замърсителите замърсяват околната среда (например чрез изхвърляне на токсични вещества или прекомерно наторяване)
4. Изменение на климата (например поради повишаване на температурите, засушаване или екстремни метеорологични явления)
5. Инвазивни видове изместват местните животински и растителни видове

Въпреки че изменението на климата не е основната причина за загубата на биологично разнообразие, значението му бързо нараства. Особено в екосистемите, които вече са били увредени, то води до оцеляване на по-малко индивиди, локално изчезване на видове и унищожаване на местообитания.

Изменението на климата се отразява на биологичното разнообразие по различни начини. Ето няколко примера:

• Поради климатичните промени се променят местообитанията и районите на разселване. Във Висбаден например сега се срещат папагали и азиатски тигров комар, които предпочитат топлия климат. От друга страна, тревната жаба трудно може да намери плитките езерца, от които се нуждае за потомството си.
• Животните и растенията променят поведението си. Много от нашите местни птици например се размножават много по-рано през сегашните по-топли пролети. Поради това кукувицата намира все по-малко гнезда, в които да снесе яйцата си, след като се завърне от зимната си квартира.
• Климатичните промени водят до намаляване на броя на индивидите при много видове. В резултат на това например огненият саламандър намира все по-малко репродуктивни партньори.

Съществуват и животински и растителни видове, които се възползват от променящите се климатични условия, например като разширяват ареала си. Въпреки това броят на потенциалните губещи от климатичните промени е значително по-голям.