L'università è sponsorizzata privatamente dalla Hochschule Fresenius gemeinnützige GmbH e continua la tradizione educativa della famiglia Fresenius. Prende il nome dalla moglie di Carl Remigius Fresenius, il fondatore del Laboratorio Chimico, su cui si basa la Hochschule Fresenius. È la prima e unica università in Germania a portare il nome di una donna.