Университет находится под частным патронажем компании Hochschule Fresenius gemeinnützige GmbH и продолжает образовательные традиции семьи Фрезениус. Он назван в честь жены Карла Ремигиуса Фрезениуса, основателя химической лаборатории, на базе которой была построена Hochschule Fresenius. Это первый и единственный университет в Германии, носящий имя женщины.