Университетът е частно спонсориран от Hochschule Fresenius gemeinnützige GmbH и продължава образователната традиция на семейство Фрезениус. Той е кръстен на съпругата на Карл Ремигиус Фрезениус, основател на Химическата лаборатория, на която се основава Hochschule Fresenius. Това е първият и единствен университет в Германия, който носи името на жена.