La Comisión para la Historia de los Judíos de Hesse se fundó en 1963 a raíz del Juicio de Fráncfort contra Auschwitz. Tenía su sede en los Archivos Estatales de Hesse Main, en Wiesbaden. El objetivo era y es investigar la historia de los judíos de Hesse sobre una base científica. Para ello se eligió la forma de una comisión histórica. La fundación fue iniciada por el Ministro de Cultura de Hesse, Prof. Ernst Schütte, y el Estado de Hesse sigue apoyando la difícil financiación, sobre todo en los primeros años, hasta el día de hoy.

La medida en que el Estado asumió esta tarea se refleja también en las personas que han presidido la comisión desde 1975, con los ministros en activo y anteriores Johannes Strelitz, Karl Krollmann y Ruth Wagner, que muestran una notable continuidad. Sin embargo, la comisión de Hesse no fue imitada en los demás estados federados. El objetivo inicial era implicar a investigadores judíos en la aún pequeña comisión, y se consiguió. Teniendo presentes los horrores de la época nazi, la investigación sobre este periodo estaba a la orden del día, pero no era el único tema.

A principios de la década de 1970, la Comisión publicó los dos volúmenes "Judíos ante los tribunales 1933-1945" y "Crímenes nazis ante los tribunales 1945-1955", que ya se habían convertido en "clásicos". Estas y otras publicaciones posteriores fueron supervisadas y promovidas en particular por Wolf-Arno Kropat. El programa incluye monografías sobre la historia general de los judíos en Hesse, la historia demográfica y social, la emancipación de los judíos y el antisemitismo, documentación sobre el destino de los judíos bajo el terror nazi, así como recursos y publicaciones de fuentes, especialmente de los archivos estatales. La oferta de libros incluye más de 30 títulos.

La documentación de los antiguos cementerios judíos de Hesse comenzó en 1981. Hasta la fecha, se han catalogado un total de 75 cementerios (de un total de casi 350) en Hesse con alrededor de 18.000 inscripciones de tumbas, incluido el cementerio judío de la "Schöne Aussicht" de Wiesbaden. Se trata de cementerios antiguos que conservan lápidas anteriores a 1800. Se fotografiaron las lápidas, se copiaron las inscripciones, se tradujeron y se completaron con más información genealógica procedente de otras fuentes, sobre todo de los registros de defunciones que se conservan del siglo XIX. Además, se elaboraron planos de los cementerios más grandes. Actualmente, los resultados se ponen a disposición de un público más amplio a través del sistema de información LAGIS de la Oficina Estatal de Estudios Históricos Regionales de Hesse, en Marburgo.

En 2008 se inició un nuevo proyecto que pretende registrar las sinagogas de Hesse en un contexto léxico.

La Comisión para la Historia de los Judíos de Hesse cuenta con unos 70 miembros que se ocupan de la historia de los judíos de Hesse en un contexto regional más amplio. Además, se presta especial atención a la cooperación con otras instituciones: las Comisiones Históricas, los Archivos Estatales de Hesse, la Oficina Estatal de Hesse para la Conservación de Monumentos Históricos, la Oficina Estatal de Hesse para Estudios Históricos Regionales, el Museo Judío de Fráncfort y el Instituto Fritz Bauer de Fráncfort. También se concede gran importancia a los contactos con las "bases" locales, que han logrado resultados extraordinarios en los últimos años.