Естественными условиями для состояния флоры и растительности в центрально-европейском ландшафте являются высота над уровнем моря, климат и почвы. В районе Висбадена высота над уровнем моря варьируется от 83 метров над уровнем моря на берегу Рейна в районе Ширштайна до 614 метров над уровнем моря на горе Хоэ Вурцель в Хохтаунусе. Климатические зоны варьируются от мягкого винодельческого климата с субсредиземноморским уклоном до прохладного и влажного климата в высокогорных районах Таунуса. С точки зрения природной среды, различные части городской территории варьируются от Рейнско-Майнской низменности и Ингельхаймского Рейнауэ до предгорий Майн-Таунуса и Рейнгау, а также от предгорий Таунуса до Хохтаунуса. Почвы варьируются от богатых питательными веществами сырых лессовых почв и выветрившихся почв третичного известняка в низинах и на нижних склонах до крайне бедных питательными веществами почв на таунусских кварцитах и глинистых сланцах на больших высотах.

Эти различные условия приводят к появлению различных форм растительности и очень богатой флоры. Потенциальная естественная растительность варьируется от аллювиальных лесов вдоль рек, дубово-грабовых лесов в известняковых районах и на нижних склонах Таунуса до буковых лесов на больших высотах. Возделываемые земли, созданные в результате расчистки в доисторические времена, значительно обогатили флору, так как в них иммигрировали сопутствующие растения из зерновых и виноделия. Транспортные пути и берега рек и сегодня являются зонами, по которым мигрируют виды растений. Однако сохранились лишь самые незначительные остатки естественной и близкой к естественной растительности.

Жилая и промышленная застройка, строительство и расширение транспортных магистралей, добыча полезных ископаемых и, прежде всего, интенсификация сельского хозяйства радикально изменили видовой спектр флоры Висбадена. В первую очередь это касается территорий к югу и востоку от более густонаселенного городского района. В течение XIX века тугайные леса и луга речных долин были в значительных масштабах уничтожены в результате превращения рек Рейн и Майн в судоходные пути. На нижних склонах Таунуса дубово-грабовые леса были заменены буковыми плантациями и еловыми лесами. Смена древесного населения в корне изменила и наземную флору лесов, которая сегодня в значительной степени исчезла из-за расширения городской застройки на склонах Таунуса. Добыча извести в районах Бибрих, Амонебург и Эрбенхайм привела к полному исчезновению приповерхностных известковых отложений, а вместе с ними и специализированных видов растений.

Коллекции отдела естественной истории Государственного музея и хранящиеся там гербарии документируют состояние флоры в середине XIX века и на рубеже XIX и XX веков. Список исчезающих видов и вымерших растений очень длинный. Леса значительно отличаются от аллювиальных лесов на Майне и Рейне и лесов на хребте Таунус. По берегам реки то тут, то там встречаются остатки тугайных лесов, в том числе многочисленные виды ив и редкий ныне черный тополь. Этот тип леса часто затапливается несколько раз в год. Лучше всего он сохранился в природном заповеднике "Валлуфер Бухт" (NSG). На реке Реттбергсауе, которая также является природным заповедником, предпринимаются попытки восстановить жестколиственный аллювиальный лес с помощью мер по уходу. Этот тип леса затапливается только при высоком уровне воды. Наземная флора обоих типов леса находится под угрозой исчезновения, так как из-за сильного вымывания азотных соединений в ней преобладают жгучая крапива и бальзамин, которые в XX веке иммигрировали из Гималаев и быстро распространяются. В прошлом дикий чеснок широко произрастал в аллювиальном лесу, но его распространение резко сократилось по вышеуказанным причинам.

В лесах на холмах, изначально чисто лиственных, с XVIII века встречаются шотландская сосна и европейская лиственница, а в XIX веке к ним добавилась ель (Picea abies). Лес вблизи центра города состоит в основном из так называемого древесно-букового леса (Galio odorati-Fagenion), в котором еще можно найти остатки некогда богатых зарослей сидячих дубов и грабов. Для него характерно присутствие древоточца, овсяницы, пестряка, луковичного зубчика, заячьего хвоста, одноцветкового жемчужника, горной золотистой крапивы (Lamiastrum montanum), трепетной травы, ведьминой травы (Circaea lutetiana) и некоторых видов папоротников. Эта лесная зона в Висбадене является центром распространения форстерского дрозда (Luzula forsteri) в Гессене и Германии, и город должен сыграть важную роль в ее защите и сохранении. На высоте 400 метров над уровнем моря кварцит Таунуса поднимается на поверхность и образует бедные питательными веществами, в основном неглубокие почвы, на которых произрастает буковый лес Хайнзимсен (Luzula fagenion). Этот тип леса значительно беднее видами растений. Он характеризуется наличием белой волосистой травы, проволочника, мягкой луговой травы и древесной травы.

Открытые участки ландшафта почти полностью являются результатом антропогенной колонизации; только там, где есть скалы, как во Фрауэнштайне и Зонненберге, можно рассчитывать на естественные безлесные участки и особые виды растений. Береговые зоны пока еще нерегулируемых рек также, по крайней мере частично, не имеют деревьев. Открытые возделываемые земли не имеют естественной растительности. Сельскохозяйственные угодья, в том числе лесные луга, были созданы в результате деятельности человека. Открытые поймы встречаются только в лесо-луговых долинах Рабенгрунда, Гольдштайнталя и верхней части Тейсталя. Там, где протекают более широкие ручьи, их сопровождает кайма ив и черных ольх; мелкие ручьи заросли вьюнком обыкновенным и вьюнком пурпурным. По краям этих водотоков часто встречаются пенник и ручьевой спидвелл.

В целом флора лесных луговых долин особенно богата. Рабенгрунд и Гольдштайнталь являются типичными примерами и играют важную роль в сохранении местной флоры. Богатство редких видов, включая орхидеи, требует строгой охраны и дорогостоящих мер по уходу. Они сохраняют ландшафтный тип сенокосных лугов, поскольку их десятилетиями не удобряли и не применяли гербициды из-за их важности для поддержания качества питьевой воды, а также не сеяли быстрорастущие кормовые травы. Старинные посевы зерновых и корнеплодов, которые можно было встретить со времен неолита до середины XX века, в значительной степени исчезли из современного сельскохозяйственного ландшафта. Виды васильков и маков, а также короставник либо полностью исчезли с полей, либо переместились на обочины дорог. Исчезновение более редких и порой малозаметных видов часто происходило раньше и незаметно. То же самое относится и к кормовым лугам, которые становятся максимально продуктивными благодаря внесению удобрений. Типы лугов, которые раньше различались и характеризовались доминирующими видами трав, исчезли из сельскохозяйственного ландшафта. Виноградники и сады, которые все еще существуют в районах на западной окраине Висбадена (Фрауэнштайн, Дотцхайм, Ширштайн и Костхайм), также потеряли типичные виды из-за механизированной обработки.

Конечно, постоянно появляются и новые виды, но число исчезающих видов значительно превышает число новых. Новые представители флоры часто экологически безвредны и колонизируют свободные экологические ниши. Однако новые виды могут вытеснять и местные виды, например, исконно североамериканский черноплодный двузубец все чаще вытесняет местный трехраздельный двузубец на берегах рек примерно с 1945 года. Анжелика архангельская перекочевала на берега рек Майн и Рейн после 1930 года. Южноафриканская узколистная амброзия (Senecio inaequidens) также быстро распространяется вдоль дорог и железнодорожных линий.