Christian s-a născut la 8 aprilie 1818 în Gottrup, Danemarca. După moartea regelui danez Frederick al VII-lea la 15 noiembrie 1863, el i-a succedat acestuia. Titlul său oficial a fost: Rege al Danemarcei, al Wendenilor și al Goților, Duce de Schleswig, Holstein, Stormarn, Dithmarschen, Lauenburg și Oldenburg. Împreună cu soția sa, Louise de Hesse-Kassel, a fondat linia Glücksburg, care asigură și astăzi moștenitorii danezi la tron. Regele Christian al IX-lea a murit la 29 ianuarie 1906 la Palatul Amalienborg din Copenhaga.

În timpul unei vizite comune cu regele Oscar al II-lea al Suediei și Norvegiei, el a semnat Cartea de Aur a orașului Wiesbaden la 14 mai 1902.