Un incendio en la ciudad destruye gran parte de la estructura del edificio, y un segundo incendio en 1561 causa daños igualmente devastadores.

Con el nombramiento de un maestro "erudito" el 1 de enero, se funda una escuela de latín, que funciona como escuela preparatoria para la escuela de gramática de Idstein. En 1844 se transforma en la actual Diltheyschule.

El 1 de enero, Wolf Denthener, conocido como Evander, es nombrado pastor evangélico luterano en Wiesbaden, introduciendo así la Reforma.

Se planta un viñedo en el Neroberg. Desde 1900, el viñedo del Neroberg es propiedad de la ciudad. Desde octubre de 2005, es gestionado por las Bodegas Estatales de Hesse Kloster Eberbach.

En el transcurso de las Guerras Campesinas, los habitantes de Wiesbaden exigen también la concesión de libertades y derechos por la fuerza de las armas. Sin embargo, su levantamiento fracasa; también pierden sus privilegios anteriores, que no se les vuelven a conceder hasta 1566.

El conde Gerlach von Nassau y sus hijos fundan un hospital en Wiesbaden para dar alojamiento y comida a los enfermos, atender a los pobres y cuidar a los ancianos. Existe hasta 1879.

Gofryet Josib y su familia son los primeros judíos residentes en Wiesbaden.

El emperador Luis el Bávaro emite el primer privilegio de acuñación para Nassau; sin embargo, sólo se conservan algunas de las monedas acuñadas en Wiesbaden.

El rey Adolfo de Nassau funda el monasterio de Klarenthal, que también sirve de lugar de enterramiento de los condes de Nassau de la línea Walram durante tres generaciones.

El arzobispo de Maguncia hace quemar la ciudad imperial de Wiesbaden; se supone que fue elevada a la categoría de ciudad imperial hacia 1232. Wiesbaden sólo puede recuperarse gradualmente de esta destrucción.

Los condes de Nassau tienen derechos de soberanía en Wiesbaden y sus alrededores.

Einhard, biógrafo de Carlomagno, menciona "wisabada"; ésta es la tradición más antigua que se conserva del nombre de Wiesbaden.

Se establece en Wiesbaden una corte real francona.

Los francos desplazan a los alemanes; hay pruebas de un cementerio franco en la parte baja de la Dotzheimer Straße en el siglo VI.

En el curso de la fortificación de la frontera renana contra las tribus germánicas, se inicia la construcción de una muralla ("Heidenmauer"); un poco más tarde, los alemanes asumen la protección de la zona de Wiesbaden como federados.

Durante una invasión de los alemanes, grandes partes del asentamiento romano fueron destruidas, como demuestran los hallazgos arqueológicos.

Primera mención del asentamiento romano como "Aquae Mattiacorum".

El fuerte del "Heidenberg" se amplió y fortificó en piedra después de que fuera destruido por un incendio en la agitación del Año de los Cuatro Emperadores 69 e inicialmente sólo se sustituyó por un fuerte de tierra.

Plinio el Viejo menciona las termas en su "Naturalis historia" y proporciona así la primera referencia literaria conocida de Wiesbaden.

Los hallazgos arqueológicos documentan un primer fuerte de tierra en el "Heidenberg", seguido de la construcción de unas termas romanas.