Използването на яйца върви ръка за ръка с многоклетъчността и по-сложните репродуктивни стратегии. Благодарение на разделението на труда за първи път се появяват специализирани клетки. В допълнение към соматичните клетки, други се използват изключително за размножаване. Тези полови клетки имат един набор хромозоми (хаплоидни) в сравнение с нормалните соматични клетки. За яйцеклетки говорим, когато в случай на полово размножаване женската, генеративна клетка ясно се различава от мъжката форма. Повечето риби са свободно размножаващи се, т.е. освобождават голям брой хайвер във водата. Те се оплождат от сперматозоидите на мъжките, които също се освобождават свободно. Сравнително малко риби се грижат за хайвера си или например прикрепят хайвера си към структури.

Яйцата на земноводните обикновено са покрити със слой гел, който набъбва във водата. В плитки води това допринася значително за повишаване на температурата, като действа като нажежено стъкло.

Преди да се преместят на сушата, организмите е трябвало да преодолеят множество трудности. Някои от тях се отразяват и на яйцето, тъй като, от една страна, съществува опасност от изсушаване на сушата, а от друга - от задушаване, ако защитата срещу изсушаване е твърде голяма. Решението е намерено преди около 320 милиона години чрез създаването на трета черупка вътре в яйцето - амнион. Това осигурява защитено езерце извън водата, така да се каже. Ембрионът се развива в амниотична торбичка, изпълнена с амниотична течност. И до днес от това се възползват люспести гущери, костенурки, крокодили, птици и бозайници. Както показва изложбата "Макс" и миниизложбата на междинния етаж, в живата природа има огромни разлики в размерите между сродни видове. Това се отразява и на яйцата. Най-малкото известно птиче яйце е от колибри (Trochilidae) и е дълго само 11 милиметра. С тегло 0,4 грама то представлява около 17 % от общото телесно тегло. Днес най-голямото е яйцето на щрауса (Struthio camelus) с дължина 15 сантиметра и тегло до 1,8 килограма. Това отговаря на около 30 кокоши яйца. В сравнение с размера на тялото обаче това яйце е малко, като заема малко под два процента от общото телесно тегло.

Пролетта, времето на пробуждане на природата, се посреща от много народи по нашите географски ширини с фестивали и различни обичаи от незапомнени времена. Някога тези пролетни празници са били посветени на предхристиянската богиня на пролетта "Остарун". От нея е произлязла думата "Великден". Многобройните европейски великденски обичаи водят началото си от предхристиянските пролетни празници. От XVII в. насам те включват широко разпространената вече практика да се търсят и раздават боядисани великденски яйца или яйца, украсени с различни сложни техники.

Оцветяването и боядисването на яйца е много стар обичай. Той ни е познат от Германия поне от IV в. В Източна Европа се предпочитат яйцата със златен цвят, докато в Централна и Западна Европа те се боядисват в червено и се наричат "великденски яйца" поне от началото на XVII в. След това се развиват и други техники за боядисване и украса, като например техниката на гравиране и драскане, восъчното босилене (нанасяне на цветен восък) и техниката на восъчния батик - шиене и бродиране на яйца. Сред многото боядисани яйца от Източна и Югоизточна Европа особено забележителни са яйцата на хуцулите (народ, който живее в няколко страни от Югоизточна Европа, освен Полша) с традиционни шарки, които се променят от време на време. Дървените яйца от България са украсени с назъбени шарки, брандиране и стикери с религиозно съдържание. Дървените яйца от Русия, които често са със сложен дизайн, са изрисувани с мотиви от религията и света на приказките, природата и фолклора. В много неевропейски и нехристиянски култури яйцето също е било и е смятано за източник на всичко живо.