31 августа 1829 года по предложению майора Антона Филиппа Фрейхерра фон Брейдбах-Бюрресхайма 141 житель Висбадена основал "Ассоциацию естественной истории в герцогстве Нассау", которая получила свое нынешнее название после присоединения Нассау к Пруссии в 1866 году.

Целью ассоциации было "...пробудить интерес к природе и ее изучению, сделать последнее возможным и способствовать его развитию посредством организованных коллекций из всех царств природы, а также придать естественной истории как можно большее значение для практической жизни". Основание музея состоялось на первом этаже здания Erbprinzenpalais (сегодня это штаб-квартира Промышленно-торговой палаты Висбадена) на Вильгельмштрассе. В это же время здесь был основан Музей естественной истории (ныне - Коллекции естественной истории в Висбаденском музее), первоначальные фонды которого включали коллекцию птиц барона фон Брейдбах-Бюрресхайма, коллекцию минералов и горных пород барона Карла вом унд цум Штайна, а также коллекцию бабочек и насекомых Иоганна Исаака Фрайхерра фон Гернинга.

В 1838 году Иоганн Карл Якоб Томаэ ввел научно-популярные лекции, которые организуются и по сей день. 1840-е годы ознаменовались первым расцветом ассоциации, которая к тому времени насчитывала более 500 действительных членов и большое количество членов-корреспондентов и почетных членов. С 1844 года ассоциация издает журнал "Jahrbuch des Nassauischen Vereins für Naturkunde", в котором на сегодняшний день опубликовано 133 тома. Здесь были опубликованы многие важные научные работы по геологии и биологии региона и содержанию NWS. Все публикации общества теперь доступны в цифровом виде на компакт-дисках, а с 2010 года первую страницу каждой специализированной статьи в ежегоднике можно также просмотреть на домашней странице общества. С 1866 года членами общества стали и женщины.

В это время председателями общества были геолог Карл Людвиг Фридолин фон Сандбергер, химик Карл Ремигиус Фрезениус, энтомолог Карл Людвиг Конрад Киршбаум, геолог и специалист по летучим мышам Карл Кох и отолог и специалист по бабочкам Арнольд Андреас Фридрих Пагенштехер. За ними последовали химик Генрих Фрезениус и геолог Август Леппла. После смерти последнего руководство ассоциацией взял на себя учитель гимназии, а затем директор школы Фридрих Хайнек, который руководил ею до 1960 года, с перерывом с 1938 по 1945 год.

В 1915 году объединение и его коллекция естественной истории переехали в северное крыло нового здания музея, построенного городом Висбаденом, которому музей принадлежал с 1900 года. Главной задачей экспозиционных коллекций Хайнек считал просвещение посетителей. В этом ему помогали геолог Макс Галладе, куратор зоологии Кристиан Фетцер и таксидермист Йозеф Бургер.

В эпоху национал-социализма Хайнек ушел с поста председателя в 193 году, и его преемником стал Карл Филл, директор Музея естественной истории с 1938 года. О судьбе членов ассоциации, которые преследовались нацистами как евреи и были вынуждены покинуть ассоциацию к 1938 году, рассказывается в ежегоднике 128/2007.

Первое послевоенное общее собрание состоялось 15 апреля 1946 года. Хайнек был вновь избран председателем. Лекции были возобновлены зимой 1946/47 года, а первые экскурсии были организованы в 1947 году. С большим трудом была восстановлена экспозиционная коллекция по естественной истории. Важную помощь оказал Фриц Нойбаур, работавший в музее с 1948 года и возглавлявший коллекцию естественной истории с 1951 года. К концу 1956 года число членов музея превысило 400 человек.

В 1960 году председателем ассоциации стал геолог Карл Франц Михельс. При его преемниках, геологах Хансйоахиме Липперте и Эрнсте Паули, число членов ассоциации неуклонно снижалось, несмотря на амбициозную программу мероприятий. Только при их преемнике с 1996 года, геологе Хансе-Юргене Андерле, число членов вновь выросло до более чем 330. Это произошло благодаря открытию ассоциации для внешнего мира и, не в последнюю очередь, благодаря усилиям ассоциации по сохранению естественнонаучной коллекции, существование которой было временно поставлено под угрозу в связи со смещением акцента в работе музея на современное искусство.

Объединение уже трижды удостаивалось золотой городской доски столицы земли Висбаден: в 1952 году после завершения строительства новой выставочной коллекции, в 1979 году по случаю 150-летнего юбилея и в 2004 году на праздновании 175-летия Курхауса.