La 31 august 1829, la sugestia maiorului Anton Philipp Freiherr von Breidbach-Bürresheim, 141 de locuitori din Wiesbaden au înființat "Asociația de istorie naturală din Ducatul Nassau", care a primit denumirea actuală după anexarea Nassau la Prusia în 1866.

Scopul asociației era "... să trezească interesul pentru natură și studiul acesteia, să facă posibil acest lucru din urmă și să îl promoveze prin colecții organizate din toate regnurile naturale și să confere istoriei naturale cât mai multă relevanță pentru viața practică". Fundația a avut loc la primul etaj al Erbprinzenpalais (astăzi sediul Camerei de Industrie și Comerț din Wiesbaden) din Wilhelmstraße. Muzeul de Istorie Naturală (în prezent Colecțiile de Istorie Naturală din cadrul Muzeului din Wiesbaden) a fost, de asemenea, înființat aici în aceeași perioadă, iar colecțiile sale inițiale includeau colecția de păsări a baronului von Breidbach-Bürresheim, colecția de minerale și roci a baronului Karl vom und zum Stein și colecția de fluturi și insecte a lui Johann Isaac Freiherr von Gerning.

În 1838, Johann Karl Jakob Thomae a introdus conferințele științifice și populare, care sunt organizate și astăzi. Anii 1840 au marcat primul apogeu al asociației, care la acea vreme avea peste 500 de membri titulari și un număr mare de membri corespondenți și de onoare. Începând din 1844, asociația a publicat Jahrbuch des Nassauischen Vereins für Naturkunde, din care au fost publicate până în prezent 133 de volume. Aici au fost publicate numeroase lucrări științifice importante privind geologia și biologia regiunii și conținutul NWS. Toate publicațiile asociației sunt acum disponibile în format digital pe CD, iar din 2010 prima pagină a fiecărui articol de specialitate din anuar poate fi vizualizată și pe pagina de pornire a asociației. Din 1866, femeile au devenit, de asemenea, membre ale asociației.

Președinții din această perioadă au fost geologul Carl Ludwig Fridolin von Sandberger, chimistul Carl Remigius Fresenius, entomologul Carl Ludwig Konrad Kirschbaum, geologul și expertul în lilieci Carl Koch și otologul și expertul în fluturi Arnold Andreas Friedrich Pagenstecher. Aceștia au fost urmați de chimistul Heinrich Fresenius și de geologul August Leppla. După moartea acestuia din urmă, Friedrich Heineck, profesor de gimnaziu și ulterior director de școală, a preluat conducerea asociației, pe care a condus-o până în 1960, cu o întrerupere între 1938 și 1945.

În 1915, asociația și colecția sa de istorie naturală s-au mutat în aripa de nord a noii clădiri a muzeului, care fusese construită de orașul Wiesbaden, care deținea muzeul din 1900. Heineck considera că principala sarcină a colecțiilor de prezentare era educarea vizitatorilor. El a fost sprijinit în acest sens de geologul Max Galladé, de conservatorul zoolog Christian Fetzer și de taxidermistul Joseph Burger.

În timpul epocii național-socialiste, Heineck a demisionat din funcția de președinte în 193, iar Karl Fill, director al Muzeului de Istorie Naturală din 1938, a devenit succesorul său. Soarta membrilor asociației care au fost persecutați de naziști ca evrei și au trebuit să părăsească asociația până în 1938 este prezentată în Anuarul 128/2007.

Prima adunare generală de după război a avut loc la 15 aprilie 1946. Heineck a fost reales în funcția de președinte. Conferințele au fost reluate în iarna 1946/47, iar primele excursii au fost organizate în 1947. Colecția de exponate de istorie naturală a fost restabilită cu mari dificultăți. Fritz Neubaur, care lucra la muzeu din 1948 și era șeful colecției de istorie naturală din 1951, a oferit un ajutor important. Numărul membrilor a crescut la peste 400 până la sfârșitul anului 1956.

În 1960, geologul Karl Franz Michels a preluat președinția asociației. Sub succesorii săi, geologii Hansjoachim Lippert și Ernst Pauly, s-a înregistrat o scădere constantă a numărului de membri, în ciuda unui program ambițios de evenimente. Abia sub succesorul lor din 1996, geologul Hans-Jürgen Anderle, numărul membrilor a crescut din nou la peste 330. Acest lucru s-a datorat deschiderii asociației către lumea exterioară și, nu în ultimul rând, eforturilor mediatice ale asociației de a păstra colecția de științe naturale, a cărei existență a fost temporar pusă în pericol de orientarea activității muzeului către arta modernă.

Asociația a fost distinsă deja de trei ori cu placheta de aur a capitalei Wiesbaden: în 1952, după finalizarea noii instalații a colecției de prezentare, în 1979, cu ocazia celei de-a 150-a aniversări, și în 2004, la sărbătorirea celei de-a 175-a aniversări în Kurhaus.