El Hospital de San José comenzó unos años después de la construcción del de San Bonifacio y también está estrechamente vinculado a la fortuna de la iglesia debido a los orígenes del edificio. El núcleo del Hospital de San José es el instituto filial de las Siervas Pobres de Jesucristo (ADJC).

Inicialmente tres, más tarde siete de las llamadas Hermanas Dernbach llegaron a Wiesbaden en 1856 para ampliar la asistencia ambulatoria. Con fondos del Vinzenzverein y donaciones privadas, se adquirió un antiguo edificio residencial con un edificio trasero y jardín en los terrenos de la parroquia católica de la Friedrichstraße, y las hermanas se trasladaron allí el 1 de octubre de 1862. Ese mismo año, el duque Adolfo de Nassau concedió a las hermanas los derechos corporativos y el nombre de "Filialinstitut der Armen Dienstmägde Jesu Christi" (Instituto Filial de las Siervas Pobres de Jesucristo). En 1876, la casa, que había servido temporalmente como hospital militar durante la guerra de 1870/71 y luego como escuela, se convirtió en hospital para el internamiento de pacientes.

En 1884 ya se había construido un nuevo edificio de cuatro plantas de estilo neogótico, el Hospital zum HeiligenGeist (Hospicio del Espíritu Santo). Pero incluso este edificio pronto se quedó pequeño; el 15 de agosto de 1892 se inauguró el nuevo Hospital de San José en su ubicación actual. A partir de entonces, aquí se trataban los casos quirúrgicos y en el hospicio todos los pacientes con dolencias internas. Tras la Primera Guerra Mundial, durante la cual el Hospital de San José volvió a utilizarse como hospital militar, se amplió el departamento de ginecología, con su propia sala de maternidad a partir de 1925. Las primeras enfermeras laicas fueron nombradas en 1930.

Muy dañado por una bomba en febrero de 1945, la planificación de un nuevo edificio comenzó a finales de la década de 1950 y se hizo realidad en 1965. Josefs-Hospital disponía ahora de todas las instalaciones de un hospital de agudos con asistencia especializada, por lo que en 1969 se derribó el antiguo Hospice zum Heiligen Geist.

En 2002 se iniciaron otras obras de gran envergadura, y en 2004 la Clínica Ortopédica de Wiesbaden encontró su hogar en el ala oeste de nueva construcción. En 2014, el último convento de las Siervas Pobres de Jesucristo se despidió del Hospital de San José, lo que dio lugar a un cambio en la estructura del patrocinio. Desde entonces, la Fundación St. Josefs-Hospital Wiesbaden, una fundación de derecho civil, es la patrocinadora.