Κατά τη διάρκεια της ναζιστικής περιόδου, η Paulinenstraße 9 φιλοξενούσε ένα γραφείο της μυστικής κρατικής αστυνομίας (Gestapo) στη Φρανκφούρτη. Οι μέθοδοι ανάκρισης της Γκεστάπο ήταν συχνά παρόμοιες με τα βασανιστήρια. Οι κρατούμενοι υπέστησαν μερικές φορές σοβαρές ψυχολογικές και σωματικές βλάβες. Για παράδειγμα, υπάρχουν καταγραφές κρατουμένων που εξαναγκάζονταν να δώσουν καταθέσεις με την απειλή όπλου. Μεταξύ άλλων, η Γκεστάπο παρενοχλούσε εδώ μέλη αντιπολιτευόμενων ομάδων νεολαίας. Αρκετοί καθολικοί και προτεστάντες κληρικοί καθώς και αλλοδαποί καταναγκαστικοί εργάτες ανακρίθηκαν επίσης και κακοποιήθηκαν στο κτίριο της Paulinenstraße 9.

Το ναζιστικό καθεστώς βασίστηκε, μεταξύ άλλων, σε έναν ολοκληρωμένο μηχανισμό αστυνομικής επιτήρησης και δίωξης. Οι αντίπαλοι του καθεστώτος και οι Εβραίοι στοχοποιήθηκαν από την αρχή. Σύντομα και άλλες μειονότητες υπέστησαν ρατσιστικές διώξεις, όπως οι λεγόμενοι "κοινοτικοί παρείσακτοι". Κατά τη διάρκεια της ναζιστικής περιόδου, οι άνθρωποι μπορούσαν να συλληφθούν και να σταλούν σε στρατόπεδο συγκέντρωσης χωρίς δικαστική απόφαση ή δυνατότητα έφεσης. Το 1936, ο Reichsführer των SS, Χάινριχ Χίμλερ, ο οποίος ήταν ήδη επικεφαλής της Πολιτικής Αστυνομίας και υπεύθυνος για τα στρατόπεδα συγκέντρωσης, διορίστηκε από τον Χίτλερ επικεφαλής της γερμανικής αστυνομίας. Αυτό σήμαινε ότι το τμήμα ποινικών ερευνών ενσωματώθηκε επίσης στη σφαίρα δράσης της Γκεστάπο, η οποία υπήρχε από το 1933. Η αστυνομία ήταν πλέον θεσμικά στενά συνδεδεμένη με τα SS. Το 1939, η αστυνομία ασφαλείας, δηλαδή η Γκεστάπο και το τμήμα εγκληματολογικών ερευνών, συγχωνεύτηκαν με την υπηρεσία ασφαλείας των SS στη λεγόμενη Κεντρική Υπηρεσία Ασφαλείας του Ράιχ. Αυτή υπαγόταν στα SS και ήταν υπεύθυνη για όλα τα όργανα της αστυνομίας και της ασφάλειας. Η Γκεστάπο διαδραμάτισε βασικό ρόλο στην προετοιμασία και την εκτέλεση των εκτοπίσεων των Εβραίων, των Σίντι, των Σίντι, των Ρομνίων και των Ρομά στα στρατόπεδα συγκέντρωσης και εξόντωσης.

Ο Δρ Χανς Μπάτερσακ εργάστηκε ως δικηγόρος στο Βισμπάντεν από το 1909. Εθνικοσυντηρητικός, ήταν περιφερειακός ηγέτης του "Stahlhelm" και μίλησε υπέρ του NSDAP το 1933. Ωστόσο, απέρριψε την ενσωμάτωση του "Stahlhelm" στα SA, οπότε συνελήφθη αρκετές φορές και τέθηκε υπό πίεση. Η "Stahlhelm" διαλύθηκε τελικά στα τέλη του 1935. Ο Δρ Μπάτερσακ βρέθηκε και πάλι στο στόχαστρο της Γκεστάπο το 1938. Φυλακίστηκε αρχικά για προσβλητική συμπεριφορά και στη συνέχεια για επτά εβδομάδες για δηλώσεις επικριτικές για το καθεστώς, μεταξύ άλλων στις αστυνομικές φυλακές Friedrichstraße. Κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου, μεταφέρθηκε αρκετές φορές στην Paulinenstraße για ανάκριση. Συνελήφθη εκ νέου στις 6 Μαΐου 1943. Ο Δρ Χανς Μπάτερσακ υπήρξε θαρραλέος ακτιβιστής της Ομολογούσας Εκκλησίας. Βοηθούσε επίσης Εβραίους ως νομικός σύμβουλος, αν και ο νόμος περί υπηκοότητας του Ράιχ της 27ης Σεπτεμβρίου 1938 το επέτρεπε αποκλειστικά στους λεγόμενους εβραίους συμβούλους. Οι Εβραίοι δικηγόροι είχαν αποκλειστεί από το δικηγορικό επάγγελμα το 1938. Το ναζιστικό καθεστώς επέτρεψε σε λίγους από αυτούς να συνεχίσουν το έργο τους ως σύμβουλοι. Στις 28 Μαΐου 1943, ο Μπάτερσακ στάλθηκε στο στρατόπεδο συγκέντρωσης Νταχάου. Πέθανε εκεί από τύφο στις 13 Φεβρουαρίου 1945.

Οι αλλοδαποί καταναγκαστικοί εργάτες παρακολουθούνταν επίσης από την Γκεστάπο. Ένα ειδικά δημιουργημένο τμήμα ήταν υπεύθυνο για την τιμωρία των καταναγκαστικών εργατών. Θα μπορούσαν να σταλούν στα λεγόμενα στρατόπεδα εργασιακής εκπαίδευσης ακόμη και για τα πιο μικρά αδικήματα. Μπορούσαν επίσης να τιμωρηθούν εξαιρετικά σκληρά, σε ορισμένες περιπτώσεις με θάνατο, χωρίς δίκη. Η Γκεστάπο ήταν επίσης υπεύθυνη για αυτές τις δίκες και τις εκτελέσεις. Στο αρχηγείο της Φρανκφούρτης υπήρχε ακόμη και μια κινητή αγχόνη για το σκοπό αυτό.

Στις αρχές του 1945, το κτίριο καταστράφηκε από βομβαρδισμό και το γραφείο μεταφέρθηκε στη συνέχεια στη Mainzer Straße 14.