El maestro panadero Adam Maldaner regentaba desde 1859 una panadería en la parte baja de la calle Friedrichstraße. Poco después, se hizo cargo de la panadería Jung, en la calle Marktstraße, junto a la "Hirschapotheke", y abrió también un pequeño café. Su hijo Wilhelm continuó al frente del negocio. En 1908 compró el local con la taberna "Zum Rappen" al otro lado de la calle (Marktstraße 34). Allí construyó un nuevo "Maldaner". La panadería y la cafetería se ubicaron en el primer piso. La planta baja albergaba una sastrería y una confección, mientras que el edificio trasero albergaba un molino de maíz y una fábrica de rusk. Hacia 1910, los Maldaner comerciaban con los nombres de "Kaffee Imperial", "Kaffee Habsburg" y "Kaffee Hohenzollern". En 1918/19, la ocupación francesa confiscó los edificios, instaló la oficina de prensa "Cooperative française" y utilizó el café como almacén de alimentos y vinos, al que sólo podían acceder los militares y civiles franceses.

Tras la muerte de Wilhelm Maldaner en 1917, su viuda se casó con el restaurador Carl Schwerdtfeger, que dio al Café Maldaner el estilo de un café vienés. En 1923, el café y la pastelería se establecieron en la planta baja, mientras que el "Konzert - Café" se creó en la primera planta y el "Arcadia - Diele" en la segunda. En 2001, Michael Schulz y su esposa Renate Winkel tomaron el relevo de Josefine Jeuck, que dirigía el café desde 1956. Hoy en día, se puede seguir disfrutando de la tradición vienesa del café en sus dos plantas. En 2011, el Café Maldaner fue el primer café de Alemania en recibir el premio "Original Viennese Coffee House".